تنوع ژنوتیپی جدایههای tumefaciens Agrobacterium و A. vitis از میزبانهای مختلف در برخی از استانهای غربی و جنوبی ایران با استفاده از نشانگر RAPD
نویسندگان
1 به ترتیب دانش آموخته کارشناسی ارشد بیماری شناسی گیاهی ،استادو استاد بیماری شناسی گیاهی دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز
2 به ترتیب دانش آموخته کارشناسی ارشد بیماری شناسی گیاهی ،استادو استاد بیماری شناسی گیاهی دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز
3 به ترتیب دانش آموخته کارشناسی ارشد بیماری شناسی گیاهی ،استادو استاد بیماری شناسی گیاهی دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز
4 دانشیار پژوهشکده بیوتکنولوژی دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز
doi
چکیده
به منظور بررسی تنوع ژنتیکی گونههای tumefaciens Agrobacterium و A.vitis در سالهای 93-1392 از باغهای مو، گلخانههای پرورش گل رز و مزارع چغندر قند در استان جنوبی (فارس) ، جنوب غربی(کهکیلویه و بویراحمد) و غربی (کردستان و کرمانشاه)، از گیاهان دارای علائم گال طوقه و ریشه نمونه برداری صورت گرفت. بر اساس ویژگیهای فنوتیپی، آزمونهای بیوشیمیایی، بیماریزایی و همچنین با استفاده از آغازگرهای عمومی جنس (virD2A/virD2C) و اختصاصی در سطح گونه (VCF/VCR و PGF/PGR) بیمارگر به عنوان، tumefaciens A. و A.vitis شناسایی شد. علاوه بر این با استفاده از جفت آغازگرهای VisF/VisRو VisFF1/R2 نوع اوپین جدایههای A.vitis تشخیص داده شد. جهت بررسی تنوع ژنتیکی بین جدایههای دو گونه tumefaciens. A و A.vitis در آزمون چندشکلی تصادفی قطعات تکثیر شدهی دیاناِی (RAPD) از 11 آغازگر تصادفی استفاده شد. در گونه tumefaciens. A جدایههای متعلق به میزبانهای مختلف در سطح تشابه 73 درصد به سه گروه و جدایههای A.vitis به دو گروه تقسیم شدند. نتایج نشان داد که جدایههای متعلق به دو گونه tumefaciens. A و A.vitis دارای تنوع زیادی بودند و جدایههای به دست آمده از یک منطقه جغرافیایی در چند گروه مختلف قرار گرفتند. همچنین بین تنوع ژنتیکی جدایههای مورد بررسی و منطقه جغرافیایی یا میزبان آنها ارتباطی وجود نداشت .با استفاده از آغازگرهای VisF/VisRو VisFF1/R2 مشخص شد که 9/57 درصد از جدایههای A.vitis دارای ژن کد کننده ویتوپین، 3/26 درصد از جدایه دارای ژن کد کننده اوپین اکتوپین / نوپالین بودند و 8/15 درصد جدایهها قادر به تکثیر هیچ یک از قطعات ذکر شده نبودند