تنوع ژنوتیپی جدایه‎های tumefaciens Agrobacterium و A. vitis از میزبان‌های مختلف در برخی از استان‌های غربی و جنوبی ایران با استفاده از نشانگر RAPD

نویسندگان

1 به ترتیب دانش آموخته کارشناسی ارشد بیماری شناسی گیاهی ،استادو استاد بیماری شناسی گیاهی دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز

2 به ترتیب دانش آموخته کارشناسی ارشد بیماری شناسی گیاهی ،استادو استاد بیماری شناسی گیاهی دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز

3 به ترتیب دانش آموخته کارشناسی ارشد بیماری شناسی گیاهی ،استادو استاد بیماری شناسی گیاهی دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز

4 دانشیار پژوهشکده بیوتکنولوژی دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز

doi
چکیده

به منظور بررسی تنوع ژنتیکی گونه­های  tumefaciens Agrobacterium و A.vitis در سال­های 93-1392 از باغ‎های مو، گلخانه‌های پرورش گل رز و مزارع چغندر قند در استان­ جنوبی (فارس) ، جنوب غربی(کهکیلویه و بویراحمد) و غربی (کردستان و کرمانشاه)، از گیاهان دارای علائم گال طوقه و ریشه نمونه برداری صورت گرفت. بر اساس ویژگی‎های فنوتیپی، آزمون­های بیو‌شیمیایی، بیماری­زایی و همچنین با استفاده از آغازگرهای عمومی جنس (virD2A/virD2C) و اختصاصی در سطح گونه (VCF/VCR و PGF/PGR) بیمارگر به عنوان، tumefaciens A. و A.vitis  شناسایی شد. علاوه بر این با استفاده از جفت آغازگرهای  VisF/VisRو VisFF1/R2 نوع اوپین جدایه‌های A.vitis تشخیص داده شد. جهت بررسی تنوع ژنتیکی بین جدایه­های دو گونه tumefaciens. A و A.vitis در آزمون چندشکلی تصادفی قطعات تکثیر شده­ی دی­ان­اِی (RAPD) از 11 آغازگر تصادفی استفاده شد. در گونه tumefaciens. A جدایه‌های متعلق به میزبان‌های مختلف در سطح تشابه 73 درصد به سه گروه و جدایه‌های A.vitis به دو گروه  تقسیم شدند. نتایج نشان داد که جدایه‌های متعلق به دو گونه tumefaciens. A و A.vitis دارای تنوع زیادی بودند و جدایه­های به دست آمده از یک منطقه­ جغرافیایی در چند گروه مختلف قرار گرفتند. همچنین بین تنوع ژنتیکی جدایه­های مورد بررسی و منطقه­ جغرافیایی یا میزبان آن­ها ارتباطی وجود نداشت .با استفاده از آغازگرهای VisF/VisRو VisFF1/R2 مشخص شد  که 9/57 درصد از جدایه­های A.vitis دارای ژن کد کننده ویتوپین، 3/26 درصد از جدایه دارای ژن کد کننده اوپین اکتوپین / نوپالین  بودند و 8/15 درصد جدایه­ها قادر به تکثیر هیچ یک از قطعات ذکر شده نبودند