تنوع ژنتیکی درون‌گونه‌ای Phytophthora cryptogea و P. drechsleri *

نویسندگان
doi
چکیده

گونه‌های Phytophthora drechsleri و P. cryptogea بیمارگرهای گیاهی اُاُمیستی با قرابت فیلوژنتیکی نزدیک هستند. به منظور ارزیابی تنوع ژنتیکی در میان این گونه‌ها، جدایه‌هایی از P. drechsleri و P. cryptogea مربوط به میزبان‌های متفاوت و از مناطق مختلف جهان به همراه جدایه‌هایی از آرایه خویشاوند آنها، P. erythroseptica، از طریق روش  میکروستلایت‌های فزون‌سازی شده تصادفی (RAMS) مطالعه شدند. این بررسی به کمک سه آغازگرِ متغیر قلاب‌دار، VHV(GT)7G، DDB(CCA)5و DHB(CGA)5انجام گرفت. در بین جدایه‌های مورد بررسی دو الگوی نواربندی متفاوت دیده شد که شامل 26 نشانگر RAMS در بین جدایه‌های P. cryptogea و P. erythroseptica و 18 نشانگر RAMS در بین جدایه‌های P. drechsleri بود. واکاوی UPGMA روی نشانگرهای RAMS نشان داد که P. cryptogea دارای تغییرات مولکولی قابل توجهی بوده که بیانگر تنوع درون‌گونه‌ای آن است. در جمعیت مورد بررسی P. cryptogea مربوط به مناطق مختلف دنیا حداقل سه گروه ژنتیکی مجزا وجود دارد که میانگین تشابه در بین این جمعیت‌ها 54-60 درصد برآورد گردید. نشانگرهای چندشکلی RAMS در جدایه‌های P. erythroseptica تقریباً همانند نشانگرهای مشاهده شده در P. cryptogea بودند و این جدایه‌ها در میان دندروگرام P. cryptogea به صورت رگه‌ای واگرا ظاهر شدند. به نظر می‌رسد که جدایه‌های P. erythroseptica به دو گروه P. cryptogea به مراتب شبیه‌ترند تا گروه سوم به دو گروه مذکور. در این بررسی هیچ‌ شواهدی مبنی بر وجود رگه‌هایی با ساختار زیست‌جغرافیایی دیده نشد. این امر ممکن است به خاطر دامنه میزبانی وسیع گونه و نقل ‌و‌انتقال جهانی رگه‌های آن باشد که به همراه گیاهان زراعی و باغی جا به‌ جا شده‌اند. براساس داده‌های به دست آمده P. drechsleri گونه‌ای همگن‌تر است، اما رگه‌هایی در آن مشاهده می‌شود که منعکس کننده‌ توزیع جغرافیایی آن است. واکاوی RAMSهیچ نوع جهت‌گیری بر اساس اختصاصیت میزبانی را در بین رگه‌های مختلف این دو گونه مشخص نکرد.