فهرست نشریات علمی دسترسی آزاد ایران

برای تعیین فراوانی ویروس وای سیب‌زمینی (Potato virus Y, PVY) در تابستان 1389 تعداد 182 نمونه دارای علایم از مزارع توتون استان گلستان جمع‌آوری و با آزمون DAS-ELISA با آنتی سرم چند همسانه‌ای مورد بررسی قرار گرفت. تعداد 90 نمونه آلوده به PVY تشخیص داده شدند. آر ان ای سه جدایه ویروس با استفاده از کیت RNX-Plus استخراج و با یک جفت آغازگر اختصاصی PVY مربوط به ناحیه CP، در واکنش RT-PCR تکثیر شد. نمونه‌های آلوده به PVY پس از الکتروفورز در ژل آگاروز در محدوده bp1000 مورد انتظار، ایجاد باند نمودند. محصول PCR به‌طور مستقیم ترادف‌یابی شد و ترادف‌های به‌دست آمده به طول850 نوکلئوتید همراه با 30 ترادف انتخاب شده از GenBank مقایسه شدند. همردیف‌سازی چندگانه و آنالیز فیلوژنتیک با ClustalX و BLAST در نرم‌افزار BioEdit انجام و درخت فیلوژنتیکی به روش maximum parsimony ترسیم گردید. آنالیز فیلوژنتیک نشان داد که جدایه‌های علی‌آباد و فاضل‌آباد از ایران همراه با جدایه‌های اسپانیا، ایتالیا و بوشهر در یک گروه و جدایه مینودشت همراه با جدایه‌های هلند، بریتانیا و تایوان در گروه دیگر قرار می‌گیرند.