ارزیابی تنوع ژنتیکی جدایه‌های Pseudomonas syringae pv. syringae عامل شانکر باکتریایی درختان میوه هسته‌دار در چند استان شمالی ایران *

نویسندگان

1 مسئول مکاتبه

2 نویسنده

3 نویسنده

4 نویسنده

doi
چکیده

باکتری (Pss) Pseudomonas syringae pv. syringae عامل بیماری‌های بسیاری روی محصولات زراعی و باغی می‌باشد یکی از مهم‌ترین بیماری‌های ناشی از این باکتری شانکر، لکه برگی و نکروز پوست در درختان میوه هسته‌دار (هلو، شلیل، زردآلو، آلو و گیلاس) است. به منظور بررسی همسانی یا تنوع جدایه‌های عامل بیماری، طی سال‌های 1386-1388 از باغات درختان میوه هسته‌دار واقع در مناطق مختلف استان‌های اردبیل، گیلان، مازندران و خراسان رضوی نمونه‌برداری صورت گرفت. باکتری‌های جداشده از بافت‌های آلوده جوانه، برگ، شاخه و تنه بر اساس آزمون‌های گروه LOPAT و GATTa، Pss شناسایی شدند. تعداد 70 جدایه مورد بررسی‌های فنوتیپی (مورفولوژیکی، فیزیولوژیک و بیوشیمیایی) و الکتروفورز پروتئین‌های سلولی ( SDS-PAGE) قرار گرفتند. جدایه‌ها از نظر خصوصیات فنوتیپی و الگوی پروتئین‌های سلولی اختلاف‌های جزئی نشان دادند. جهت ارزیابی تنوع ژنتیکی، DNA ژنومی جدایه‌ها استخراج و در واکنش زنجیره‌ای پلیمراز (rep-PCR) با استفاده از آغازگرهای ERIC و REP بررسی شد. آنالیز خوشه‌ای نتایج به دست آمده نشان داد که در ERIC-PCR در سطح تشابه 75 درصد، جدایه‌ها به 8 گروه و با  REP-PCR به 5 گروه و با ترکیب همه آغازگرها به 9 گروه تقسیم شدند. نتایج نشانگر وجود تنوع ژنتیکی درون جدایه‌های Pss عامل بیماری شانکر درختان میوه هسته‌دار بود.