فهرست نشریات علمی دسترسی آزاد ایران

سارس کرونا ویروس 2 منجر به بیماری کووید-19 به‌عنوان یک بیمار­­­ی همه­گیر توسط سازمان جهانی بهداشت (WHO) گزارش‌شده است. در این ویروس یکی از پروتئازهای سیستئین ضروری که پروتئاز اصلی نامیده می­شود، هدف دارویی مناسبی برای بسیاری از مهارکننده‌های گیاهی و شیمیایی است. بررسی وابستگی اتصال مهارکننده­ها به پروتئاز اصلی سارس کرونا ویروس2 یکی از عوامل تأثیرگذار در کارایی آن­هاست. در این مقاله وابستگی اتصال داروهای گیاهی ازجمله نیجلیدین از گیاه سیاه­دانه و لیکوریتیژنین از گیاه شیرین­بیان بر پروتئاز اصلی از سارس کرونا ویروس 2 با استفاده از شبیه­سازی دینامیک مولکولی هدایت­شده موردبررسی قرارگرفته­ و با داروی شیمیایی رمدسیویر مقایسه شده است. نتایج نشان دادند که در بین لیگاندهای گیاهی، نیجلیدین بیشترین نیروی جداشدگی را به خود اختصاص می­دهد. این امر در حالی است که رمدسیویر به‌عنوان یک مهارکننده شیمیایی دارای بیشترین نیروی جداشدگی در مقایسه با مهارکننده­های گیاهی است. همچنین انرژی­ الکترواستاتیک و واندروالس برای مجموعه رمدسیویر و پروتئاز اصلی نسبت به سایر مهارکننده­های گیاهی مقدار منفی­تری را نشان می­دهد. بنابراین باوجود امتیاز اتصال بالای ترکیبات سیاه­دانه و شیرین­بیان، رمدسیویر تحت عنوان یک ترکیب شیمیایی وابستگی اتصال بیش­تری را نشان می­دهد.