اثر سطوح مختلف دامهای تعیین ژنوتیپ شده در ارزیابی ssGBLUP بر صحت و پاسخ به انتخاب: یک مطالعه شبیهسازی
نویسندگان
1 گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تهران، کرج، ایران.
2 گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران.
3 گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران.
doi
10.22059/ijas.2025.395855.654078چکیده
هدف پژوهش حاضر، بررسی اثر سطوح مختلف دامهای تعیین ژنوتیپ شده در ارزیابی ssGBLUP همراه با سطوح مختلف خطای شجره و وراثتپذیری صفت از طریق شبیهسازی بود. برای انجام تحقیق، صفت میانگین وزن شیرگیری برهها در طی پنج نسل شبیه سازی شد. از صحت انتخاب و پاسخ به انتخاب صفت مذکور برای مقایسه اثر سناریوهای مختلف استفاده شد. سناریوها شامل پنج سطح از دامهای تعیین ژنوتیپ شده و دو عامل خطای شجره و وراثتپذیری، هرکدام با سه سطح بود. از نرم افزار R برای انجام این شبیهسازی استفاده شد. با افزایش درصد دامهای تعیین ژنوتیپ شده در ارزیابی ssGBLUP، صحت انتخاب افزایش یافت ولی مقادیر عددی صحت انتخاب در سطوح مختلف وراثتپذیری اختلاف کمتری نشان داد. میانگین صحت در سناریوی دامهای فاقد اطلاعات ژنوتیپی، و سطوح مختلف خطای شجره و وراثتپذیری، 5/0 بود، و برای سناریوی با 100 درصد از دامهای تعیین ژنوتیپ شده، معادل 79/0 بود. در سناریوی دامهای فاقد اطلاعات ژنوتایپینگ، سطوح خطای شجره ارتباط معکوسی با صحت ارزیابیهای ssGBLUP داشت. با افزایش درصد دامهای تعیین ژنوتیپ شده، ارتباط خطای شجره با صحت ارزیابیهای ssGBLUP کمتر شد. با افزایش درصد دامهای تعیین ژنوتیپ شده، میانگین پاسخ به انتخاب نیز افزایش یافت. خطای شجره در سناریویی که تمام دامهای فاقد اطلاعات ژنوتیپی بودند اثر معنی داری را نشان داد. با افزایش درصد دامهای دارای اطلاعات ژنوتیپی، اثر خطای شجرهتصحیح شده و اثر آن بر میزان پاسخ به انتخاب کمتر شد. با توجه به نتایج حاصله از تحقیق حاضر، میتوان گفت ssGBLUP گزینه بسیار مناسبی برای تحلیل ژنتیکی جمعیتهای دامی کوچک است.