اثر سطوح مختلف دام‌های تعیین ژنوتیپ شده در ارزیابی ssGBLUP بر صحت و پاسخ به انتخاب: یک مطالعه شبیه‌سازی

نویسندگان

1 گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تهران، کرج، ایران.

2 گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران.

3 گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران.

doi
10.22059/ijas.2025.395855.654078
چکیده

هدف پژوهش حاضر، بررسی اثر سطوح مختلف دام­های تعیین ژنوتیپ شده در ارزیابی ssGBLUP همراه با سطوح مختلف خطای شجره و وراثت­پذیری­ صفت از طریق شبیه­سازی بود. برای انجام تحقیق، صفت میانگین وزن شیرگیری بره­ها در طی پنج نسل شبیه سازی شد. از صحت انتخاب و پاسخ به انتخاب صفت مذکور برای مقایسه اثر سناریوهای مختلف استفاده شد. سناریوها شامل پنج سطح از دام­های تعیین ژنوتیپ شده و دو عامل خطای شجره و وراثت­پذیری، هرکدام با سه سطح بود. از نرم افزار R برای انجام این شبیه­سازی استفاده شد. با افزایش درصد دام­های تعیین ژنوتیپ شده در ارزیابی ssGBLUP، صحت انتخاب افزایش یافت ولی مقادیر عددی صحت انتخاب در سطوح مختلف وراثت­پذیری اختلاف کمتری نشان داد. میانگین صحت در سناریوی دام­های فاقد اطلاعات ژنوتیپی، و سطوح مختلف خطای شجره و وراثت­پذیری، 5/0 بود، و برای سناریوی با 100 درصد از دام­های تعیین ژنوتیپ شده، معادل 79/0 بود. در سناریوی دام­های فاقد اطلاعات ژنوتایپینگ، سطوح خطای شجره­ ارتباط معکوسی با صحت ارزیابی­های ssGBLUP داشت. با افزایش درصد دام­های تعیین ژنوتیپ شده، ارتباط خطای شجره با صحت ارزیابی­های ssGBLUP کمتر شد. با افزایش درصد دام­های تعیین ژنوتیپ شده، میانگین پاسخ به انتخاب نیز افزایش یافت. خطای شجره در سناریویی که تمام دام­های فاقد اطلاعات ژنوتیپی بودند اثر معنی داری را نشان داد. با افزایش درصد دام­های دارای اطلاعات ژنوتیپی، اثر خطای شجره­­تصحیح شده و اثر آن بر میزان پاسخ به انتخاب کمتر شد. با توجه به نتایج حاصله از تحقیق حاضر، می­توان گفت ssGBLUP گزینه بسیار مناسبی برای تحلیل ژنتیکی جمعیت­های دامی کوچک است.