استفاده از روش آماری بیز در شناسایی عوامل ژنتیکی موثر بر وزن بدن در سنین نهایی رشد در یک جمعیت از جوجه های گوشتی آمیخته
نویسندگان
1 گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران
2 گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران
3 گروه علوم دامی دانشکده کشاورزی دانشگاه تربیت مدرس تهران ایران
4 گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران
doi
10.22059/ijas.2024.379554.654021چکیده
صفت وزن بدن بهعنوان یک صفت پلیژنیک در اصلاح نژاد دام اثر بالایی بر سودآوری صنعت پرورش مرغ دارد. ازاینرو، شناسایی جایگاههای ژنتیکی مرتبط با این صفت حائز اهمیت است. در مطالعات پویش ژنوم معمولی، تجزیهوتحلیلها بر اساس رگرسیون تک نوکلئوتیدی بر حسب فنوتیپهای مشاهدهشده میباشد. در این روشها، فرض بر این است که کل متغیرهای ژنتیکی، از یک توزیع آماری نرمال پیروی میکنند که با یافتههای جدید در مورد نقش بیشتر برخی جایگاههای ژنومی و نقش کمتر برخی دیگر، همخوانی ندارد. برخلاف این روشها، در روشهای بیزی، امکان تعریف بیش از یک توزیع آماری برای اثرات متغیرها وجود دارد. ازاینرو، مطالعهی حاضر باهدف شناسایی نشانگرهای تک مارکری مؤثر بر صفت وزن بدن مرغ در سنین پایانی رشد (9، 10، 11 و 12 هفتگی) و با استفاده از اطلاعات نسل دوم جوجههای آمیخته ایجاد شده از تلاقی دوطرفه بین لاین آرین و مرغهای بومی استان آذربایجان با استفاده از روش بیز Cpi انجام شد. در نهایت، 10 نشانگر معنیدار برای وزن بدن در سنین مختلف شناسایی شدند. این SNPها بهصورت سببی و یا بهواسطه وجود عدم تعادل پیوستگی با هشت ژن که بر روی شش کروموزوم توزیعشدهاند، بهطور معنیداری بر صفات مورد مطالعه اثرگذارند. از ژنهای شناسایی شده، هفت ژن، کد کننده پروتئین و یک ژن ncRNA میباشند. برای شناسایی ژنهای مرتبط با هر SNP در مناطق کاندیدا، Mb 0/5 اطراف هر SNP معنیدار در نظر گرفته شد. نتایج مطالعه حاضر، در انتخاب ژنومی و انتخاب به کمک نشانگر یا ژن برای بهبود سرعت رشد در مرغ موثر میباشند