مطالعه روابط تکاملی و فیلوژنتیکی ژن گلوتاتیون ‌پراکسیداز-۱ در جمعیت‌های خزک و رأس 308

نویسندگان

1 هیات علمی دانشگاه زابل، تخصص: ژنتیک و اصلاح نژاد دام/ ژنتیک کمی/ ژنومیکس و انتخاب ژنومیک/ مکان‌یابی ژنی

2 دانشگاه علوم پزشکی سمنان

3 گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، زابل، ایران

4 گروه علوم دامی ، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل

doi
10.22059/jap.2018.252055.623260
چکیده

استرس گرمایی یکی از مهمترین عوامل استرس­زای محیطی است که تولید طیور در دنیا به‌خصوص در مناطق گرم همانند استان سیستان و بلوچستان در ایران را با چالش همراه کرده است. استرس گرمایی موجب افزایش تولید رادیکال­های آزاد در بدن پرندگان می­شود. گلوتاتیون پراکسیداز نقش مهمی به‌عنوان آنتی­اکسیدان سلولی در استرس گرمایی ایفا می­کند. هدف از انجام این پژوهش، تجزیه تکاملی و فیلوژنتیک توالی نوکلئوتیدی GPX-1 در دو جمعیت راس ۳۰۸ و خزک بود. نمونه­های خون از ۱۰ پرنده از دو جمعیت خزک و راس ۳۰۸ به‌طور تصادفی جمع­آوری شد (پنج قطعه از خزک و پنج قطعه راس ۳۰۸). DNA از خون کامل استخراج شد. تکثیر PCR قطعه ۸۰۰ جفت بازی از GPX-1 با استفاده از یک جفت پرایمر اختصاصی انجام گرفت. سپس محصول تکثیر برای توالی­یابی DNA ارسال شد. همردیفی توالی قطعات GPX-1 در مجموع نه هاپلوتیپ و ۱۳ ناحیه متغیر را نمایان ساخت. از ۱۳ ناحیه چندشکل، پنج ناحیه جهش­های نقطه­ای بودند. ترسیم درخت فیلوژنتیک تشابه ژنتیکی بالایی را در بین دو جمعیت مورد مطالعه نشان داد، اما تفرق در درون جمعیت­ها نشان می­دهد که امکان بهبود، تغییرات ژنتیکی و افزایش مقاومت به استرس­های محیطی در نتیجه انتخاب وجود دارد. نتایج فاصله ژنتیکی و نواحی چند­شکل GPX-1 در گونه‌های مختلف درخت فیلوژنتیک را تأیید نمودند. مطالعه فرآیندهای انتخاب مثبت نشان داد که انتخاب و تکامل نقش مهمی در فهم نقش زیستی این ژن دارند.