کاوش ژنومی نشانه های انتخاب جهت شناسایی مکان های کروموزومی مرتبط با بیماری یون در گاوهای هلشتاین

نویسندگان

1 گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، البرز، ایران:

2 گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، البرز، ایران

3 گروه علوم دامی ، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، ایران.

4 گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه بوکو، وینا، اتریش

5 گروه علوم دامی، پردیس ارس، دانشگاه تهران، جلفا، ایران

doi
10.22059/ijas.2024.367917.653972
چکیده

انتخاب باعث ایجاد نشانه­های انتخاب در سطح ژنوم می­­شود. شناسایی نشانه­های انتخاب در حیوانات در جهت ارتقا صفات اقتصادی و کاهش بیماریها، یکی از اصلی­ترین و چالش برانگیزترین تحقیقات در زمینه ژنتیک جمعیت است. در این تحقیق، با هدف شناسایی مناطق ژنومی تحت انتخاب مثبت بین جمعیت­های گاوهای مبتلا به بیماری یون و سالم هلشتاین، پویش گستره ژنوم با استفاده از چندشکلی­های تک نوکلئوتیدی (SNP) انجام شد. این تحقیق بر روی گاو­های گاوداری فوکا در اصفهان بر روی 145 راس گاو هلشتاین انجام شد. بر اساس تراشه‌های 30K شرکت ایلومینا تعیین ژنوتیپ و گاو­ها به دو گروه بیمار و سالم گروه بندی شدند. گروه بیمار شامل 45 راس و گروه سالم شامل 100 راس گاو بود. در این مطالعه برای شناسایی مناطق ژنومی تحت انتخاب از دو آماره FST و XP-EHH استفاده شد. ژن­های شناسایی شده توسط آماره FST در دو جمعیت بیمار و سالم شاملRAB37, ZC3H10, ESR1 HSD17B6, KCNC4, ERBB3 و NACA بودند. ژن­های شناسایی شده توسط آماره XP-EHH در دو جمعیت بیمار و سالم شاملAK1, ATP8A1, BTBD1, C1GALT1, CCDC6, CEP295, CLGN, CLSTN2, EHHADH,  ERBB4, FRK, GRID2, GRIP1 و LRP6  بودند. اکثر ژن های شناسایی شده در این مطالعه با ایمنی، بیماری هایی مثل سرطان، شیردهی، ماهیچه های اسکلتی، چرخه فحلی، مصرف خوراک، چسبندگی اسپرم و رشد در ارتباط بود، که جزو صفات و ویژگی های مهم زیستی جاندار قرار می گیرد. مطمئناً مطالعات گسترده­تر با تعداد نمونه­های بیشتر، درک بهتری از ژن­های کاندید برای بیماری یون در گاو و طراحی برنامه­های اصلاح نژادی موفق در جهت کاهش هزینه­های ناشی از بیماری، ایجاد خواهد نمود.