فهرست نشریات علمی دسترسی آزاد ایران

رنگ پوشش، یکی از صفات مهم اقتصادی در گوسفند بوده و همچنین می‌تواند در شناسایی و تعیین خصوصیات نژادی مورد استفاده قرار گیرد. هدف پژوهش حاضر، مطالعه پویش کل ژنوم و آنالیز مسیرهای زیستی بر مبنای تجزیه و تحلیل غنی­سازی مجموعه ژنی جهت شناسایی جایگاه­ها و ژن‌های مرتبط با صفت رنگ پوشش گوسفندان لری-بختیاری بوده است. پویش کل ژنوم بر اساس روش مورد-شاهدی در برنامه PLINK نسخه 90/1 انجام شد. آنالیز غنی­سازی مجموعه ژنی با بسته نرم­افزاری goseq برنامه R نسخه 1/6/3 با هدف شناسایی سطوح عملکردی و مسیرهای زیستی ژن‌های نزدیک در مناطق انتخابی کاندیدا انجام شد و در نهایت برای آنالیز بیوانفورماتیکی از پایگاه­های برخط GO، Metacyc، KEGG، Reactome و Panther استفاده گردید. در این پژوهش نشانگر تک نوکلئوتیدی معنی­دار روی کروموزوم­های 1، 2، 6، 9، 10­ و 16 شناسایی شدند که با ژن‌های EDNRB، PDGFRA، TCF25 و TYRP1 مرتبط بودند. در آنالیز غنی­سازی مجموعه ژنی تعداد 5 مسیر هستی­شناسی ژنی با صفت رنگ پوشش مرتبط بودند (05/0P<). از این بین، مسیرهای Regulation of protein tyrosine kinase activity، Regulation of protein kinase A signaling وActivation of protein kinase activity نقش مهمی در رشد و توسعه ملانوسیت­ها و تنظیم رنگدانه ­ها در بدن داشتند. با توجه به تأیید ارتباط برخی از مناطق ژنومی شناسایی شده در تحقیق حاضر با رنگ پوشش در گوسفند و بعضی گونه­های دیگر و همچنین شناسایی مناطق ژنومی جدید، ژن‌های شناسایی شده در این مطالعه می­توانند به عنوان ژن‌های کاندیدا برای مطالعات تکمیلی و نهایتا در انتخاب ژنتیکی رنگ پوشش در گوسفند مورد استفاده قرار گیرد.