فهرست نشریات علمی دسترسی آزاد ایران

به منظور شناسایی نشانه­های انتخاب بین گاوهای نژادهای بومی با نژاد هلشتاین از اطلاعات ژنومی 153 رأس گاو بومی (شامل 63 رأس سرابی، 44 رأس نجدی و 46 رأس تالشی) و 60 رأس گاو هلشتاین با در نظر گرفتن 46 رأس گاو نژاد برهمن به عنوان نژاد خارج گروهی استفاده شد. جهت تعیین ژنوتیپ نمونه­ها از تراشه­های Illumina Bead Chip 40K (برای نژادهای بومی) وIllumina Bead Chip 770K (برای نژاد هلشتاین و برهمن) استفاده شده بود. اطلاعات ژنومی نژادهای خارجی از پایگاه داده WIDDE استخراج گردید. پس از اجرای مراحل مختلف کنترل کیفیت داده­ها، برای شناسایی نشانه­های انتخاب از روش آماری hapFLK با نرم­افزار hapFLK v1.4 استفاده شد و با در نظر گرفتن 1/0درصد بالای ارزش hapFLK، نشانه­های انتخاب روی کرموزوم­ 25 با استفاده از ابزار Ensmble Biomart شناسایی شدند که شامل 57 ژن بودند. سپس با استفاده از پایگاه­ اطلاعاتی PANTHER عملکرد بیولوژیکی کلی ژن­ها بررسی شده و QTL­های موجود در ناحیه مورد انتخاب با استفاده از پایگاه داده Animalgenome استخراج شدند و ژن­ها با تحقیقات دیگر نیز مقایسه شدند. نتایج حاصل نشان داد این ژن­ها با مسیرهای بیولوژیکی مختلف مانند فعالیت وابسته به ATP، اتصال، فعالیت کاتالیزوری، فعالیت آداپتور مولکولی، تنظیم­کننده عملکرد مولکولی، فعالیت مبدل مولکولی، فعالیت تنظیم­کننده رونویسی و فعالیت انتقالی در ارتباط بودند. QTL­های گزارش شده در این نواحی نیز با صفات قد و ارتفاع جدوگاه، میزان شیر و محتویات شیر، میزان آهن عضلانی، صفات مربوط به وزن بدن و آسان­زایی ارتباط داشتند.