شناسایی ژن‌های مؤثر بر میزان چربی محوطۀ بطنی جوجه‏‌‏های گوشتی با استفاده از داده‌های ‏ریزآرایه و توالی‌یابی ‏RNA

نویسندگان

1 دانشیار ژنتیک و اصلاح نژاد دام گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه ‏تهران، کرج، ایران

2 دانشجوی سابق دکتری ژنتیک و اصلاح نژاد دام گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ‏ایران

3 دانشجوی کارشناسی ارشد، ژنتیک و اصلاح نژاد دام گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی ‏و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران

4 استاد ژنتیک و اصلاح نژاد دام گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران

doi
10.22059/ijas.2019.281245.653703
چکیده

امروزه انتخاب ژنتیکی برای افزایش رشد و تولید پروتئین حیوانی با کیفیت بالا در جوجه‏‌‏های گوشتی (Gallus gallus domesticus)، معمولاً منجر به افزایش وزن بیش از حد خواهد شد که نتیجۀ آن تأثیر منفی بر راندمان مصرف خوراک و کیفیت لاشه مانند افزایش چربی محوطه بطنی می­شود. هدف این مطالعه استفاده از پروفایل ترانسکریپتوم بافت چربی دو دسته جوجه‏‌‏های گوشتی با چربی زیاد و کم در محوطۀ بطنی، به‏‌‏منظور شناسایی ژن­های مؤثر در متابولیسم و ذخیره چربی می­باشد. در تجزیه داده­های ریزآرایه و RNA-seq برای بیان تفاوت ژنی به­ترتیب 2914 و 1867 ژن استخراج شد که در مجموع با مقایسه ژن­های شناسایی­شده که تفاوت بیانی معنی­داری داشتند (000001/0P<)، 1835 ژن شناسایی شد. سپس با مقایسه تعداد ژن مربوطه در میان پروفایل­های ترانسکریپتوم، ژن­های مشترک مرتبط شامل THBS1، COLEC12، ANXA7، RGS19، TMEM258 و HTR7L بودند که در فرآیند اصلی مسیرهای کنترل سنتز، متابولیسم و ذخیره چربی و مسیر سیگنالینگ غدد درون­ریز فعال شده توسط آدیپوکین­ها دارای نقش می­باشند. تجزیه و تحلیل ترانسکریپتوم مرتبط با ذخیره چربی محوطه بطنی می­تواند بیان­کننده نقش آن به‏‌‏عنوان یک اندام متابولیک و درون­ریز در جوجه‏‌‏های گوشتی باشد.