برآورد اندازه مؤثر جمعیت گاومیشهای آبی ایران با استفاده از اطلاعات ژنومی
نویسندگان
1 استاد، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، ایران
2 دانشیار، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، ایران
3 استادیار، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، ایران
4 استادیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ارومیه، ارومیه، ایران
5 استادیار، مؤسسه تحقیقات علوم دامی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران
doi
10.22059/ijas.2017.228198.653513چکیده
به منظور تعیین اندازه مؤثر جمعیتهای گاومیش ایران از 407 رأس حیوان (260 آذری، 120 خوزستانی و 27 مازندرانی) نمونهگیری بهعمل آمد. نمونهها بعد از استخراج DNA، با استفاده از آرایه های ژنومیکیAxiom Buffalo Genotyping 90K Array، تعیین ژنوتیپ شدند. اندازه مؤثر جمعیت از 700 تا 4 نسل قبل با استفاده از اطلاعات پیوستگی که برای نمونه تصحیح شده بودند و برای نسل حاضر با استفاده از نرمافزار (V2)NeEstimator و بر اساس روش هتروزیگوسیتی اضافی، محاسبه گردید. نتایج بهدست آمده برای نسل حاضر نشان میدهد که اندازه مؤثر جمعیتهای آذری و خوزستانی نسبتاً بالا است و این جمعیتها از لحاظ ژنتیکی در معرض انقراض قرار ندارند. ولی شیب بالای کاهش اندازه جمعیت برای این جمعیتها نگرانکننده است و بایستی جهت حفظ اندازه مؤثر جمعیت مطلوب و تنوع قابل قبول برای این جمعیتها برنامهریزی صورت گیرد. همچنین نتایج بهدستآمده برای جمعیت مازندرانی نشان میدهد این جمعیت از لحاظ ژنتیکی در معرض انقراض قرار دارد. بنابراین بایستی اندازه مؤثر جمعیت به دقت کنترل گردد و نیز با اقتصادیکردن تولید و طراحی تلاقیهای مناسب از افزایش همخونی و انقراض ژنتیکی این جمعیت جلوگیری کرده و جمعیت را حفاظت ژنتیکی کرد.