مقایسه میزان هوموزیگوسیتی در جایگاه‌های SNP و ROH در گاوهای شیری پر ‌تولید و کم‌ تولید هلشتاین

نویسندگان

1 استاد، گروه علوم‌دامی، پردیس کشاورزی و منابع‌طبیعی دانشگاه تهران، کرج

2 دانشجوی دکتری ژنتیک و اصلاح نژاد دام، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج

3 استاد، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع‌طبیعی دانشگاه تهران، کرج

4 استادیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ایالتی آیووا، ایالات متحده امریکا

doi
10.22059/ijas.2018.246333.653587
چکیده

افزایش هوموزیگوسیتی حاصل از آمیزش حیوانات خویشاوند، به­عنوان یکی از چالش­های فرا روی صنعت پرورش گاو شیری می­باشد که توجه زیادی را به خود جلب کرده است. پژوهش حاضر به ­منظور بررسی هوموزیگوسیتی بر مبنای جایگاه­های SNP و ROH در دام­های پر ­تولید و کم ­تولید هلشتاین انجام شده است. در این مطالعه، برای تعیین حیوانات کاندیدا برای تعیین ژنوتیپ از دو رویکرد تابعیت تصادفی و شاخص شجره­ای استفاده شد. برای این منظور، نمونه­گیری از 150 رأس گاو شیری (75 دام با ارزش اصلاحی بالا و 75 دام با ارزش اصلاحی پایین برای صفت تولید شیر) انجام شد. یک روش بهینه به­ منظور انتخاب حیوانات کاندیدا برای تعیین ژنوتیپ، از طریق تلفیق برآوردهای حاصل از تابعیت تصادفی و شاخص شجره­ای ارائه گردید. ارزش­های اصلاحی ژنومی برای دو گروه نشان داد که تاکید بر افزایش سطح تولید در دام­های پر تولید، اثر منفی بر روی صفات مرتبط با باروری (55/0- = DPR) و طول­عمر تولیدی (1/0=PL) داشته است. همچنین، میزان هوموزیگوسیتی بر مبنای ROH دامنه­ای از تغییرات را برای کروموزوم­های مختلف در دام­های با سطح تولید بالا و پایین نشان داد که ممکن است با تفاوت در سطح تولید این دو گروه و پراکنش غیر یکنواخت ژن­های مؤثر بر میزان تولید بر روی کروموزوم­های مختلف در ارتباط باشد.