مقایسه میزان هوموزیگوسیتی در جایگاههای SNP و ROH در گاوهای شیری پر تولید و کم تولید هلشتاین
نویسندگان
1 استاد، گروه علومدامی، پردیس کشاورزی و منابعطبیعی دانشگاه تهران، کرج
2 دانشجوی دکتری ژنتیک و اصلاح نژاد دام، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج
3 استاد، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابعطبیعی دانشگاه تهران، کرج
4 استادیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ایالتی آیووا، ایالات متحده امریکا
doi
10.22059/ijas.2018.246333.653587چکیده
افزایش هوموزیگوسیتی حاصل از آمیزش حیوانات خویشاوند، بهعنوان یکی از چالشهای فرا روی صنعت پرورش گاو شیری میباشد که توجه زیادی را به خود جلب کرده است. پژوهش حاضر به منظور بررسی هوموزیگوسیتی بر مبنای جایگاههای SNP و ROH در دامهای پر تولید و کم تولید هلشتاین انجام شده است. در این مطالعه، برای تعیین حیوانات کاندیدا برای تعیین ژنوتیپ از دو رویکرد تابعیت تصادفی و شاخص شجرهای استفاده شد. برای این منظور، نمونهگیری از 150 رأس گاو شیری (75 دام با ارزش اصلاحی بالا و 75 دام با ارزش اصلاحی پایین برای صفت تولید شیر) انجام شد. یک روش بهینه به منظور انتخاب حیوانات کاندیدا برای تعیین ژنوتیپ، از طریق تلفیق برآوردهای حاصل از تابعیت تصادفی و شاخص شجرهای ارائه گردید. ارزشهای اصلاحی ژنومی برای دو گروه نشان داد که تاکید بر افزایش سطح تولید در دامهای پر تولید، اثر منفی بر روی صفات مرتبط با باروری (55/0- = DPR) و طولعمر تولیدی (1/0=PL) داشته است. همچنین، میزان هوموزیگوسیتی بر مبنای ROH دامنهای از تغییرات را برای کروموزومهای مختلف در دامهای با سطح تولید بالا و پایین نشان داد که ممکن است با تفاوت در سطح تولید این دو گروه و پراکنش غیر یکنواخت ژنهای مؤثر بر میزان تولید بر روی کروموزومهای مختلف در ارتباط باشد.