واکاوی بیوانفورماتیکی و فیلوژنی ناحیه 5`UTR ژن نوروپپتید وای (Neuropeptide Y) و ارتباط آن با صفات تولیدی در مرغ بومی فارس
نویسندگان
1 دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز
2 دانشجوی دکتری، پژوهشکده زیستفناوری، دانشگاه شیراز
3 دانشجوی سابق کارشناسی ارشد اصلاح نژاد، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز
4 دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز
5 استاد، پژوهشکده زیستفناوری، دانشگاه شیراز
6 مربی، بخش تحقیقات علوم دامی، مرکز تحقیقات، آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان فارس، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، شیراز، ایران
doi
10.22059/ijas.2018.262962.653652چکیده
این پژوهش بهمنظور بررسی فیلوژنی و بیوانفورماتیکی جهش تکنوکلئوتیدی در ناحیه 5`UTR ژن نوروپپتید وای (Neuropeptide Y=NPY) و ارتباط آن با صفات تولید تخممرغ و وزن بدن در مرغان بومی استان فارس، انجام گرفت. از 200 قطعه مرغ بومی ایستگاه پرورش و اصلاحنژاد مرغ بومی استان فارس خونگیری انجام شد. استخراج DNA با روش نمکی انجام شد. جهش تکنوکلئوتیدی ژن NPY با تکنیک PCR-RFLP شناسایی شد. فراوانی آللهای A و B بهترتیب 46/0 و 54/0 برآورد شد و جمعیت مورد مطالعه در تعادل هاردی-واینبرگ نبود. واکاوی آماری نشان داد که، بین چندریختی نوروپپتید وای و صفات مورد مطالعه (شمار تخممرغ، اولین سن تخمگذاری، وزن تخممرغ در 84 هفتگی و وزن بدن در 12 هفتگی) ارتباط معنیداری وجود ندارد. همچنین، واکاوی فیلوژنی نشان داد که ناحیه توالییابیشده ژن NPY مرغ بومی فارس با اطلاعات توالیهای EU447658.1 و EU447659.1 دارای بیشترین شباهت است. نکته قابل توجه در واکاوی فیلوژنی، وجود ژن NPY از گونه بلدرچین بود که میتواند نشان دهنده نقش کلیدی این ژن در تنظیم فرآیندهای فیزیولوژیک محسوب گردد.
