شناسایی نواحی تحت انتخاب مثبت در ژنگان اسبهای کرد و عرب ایرانی با استفاده از روش مبتنی بر نامتعادلی پیوستگی ژنی
نویسندگان
1 دانشجوی دکتری، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج
2 استاد، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج
3 دانشیار، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج
doi
10.22059/ijas.2018.259151.653640چکیده
اسبهای عرب به داشتن عملکرد خوب در مسابقههای استقامتی، پرش و زیبایی شهرت دارند. اسبهای کرد بومی منطقههای کوهستانی غرب ایران، مناسب مسابقههای چوگان هستند. اسبهای کرد، قد کوتاهتر و وزن سنگینتری نسبت به اسبهای عرب دارند. در این بررسی آمارۀ XP-EHH که مبتنی بر نامتعادلی پیوستگی ژنی (لینکاژی) است برای شناسایی قطعههای کروموزومی تحت انتخاب در ژنگان (ژنوم) اسبهای کرد و عرب ایرانی استفاده شد. برای این منظور، از نمونۀ خون و مو 38 اسب عرب و 58 اسب کرد DNA ژنگانی استخراج شد. همۀ نمونهها DNA توسط آرایۀ Axiom MNEC670 تعیین نژادگان (ژنوتیپ) شدند. پس از پالایش دادهها آمارۀ XP-EHH محاسبه شد. در اسبهای عرب 51 جایگاه (85 ژن) و در اسبهای کرد 7 جایگاه (13 ژن) تحت انتخاب شناسایی شد. نواحی تحت انتخاب در اسبهای عرب با مسیرهای درگیر در سامانۀ ایمنی، تشکیل پروتئین شیر، رشد و نمو و سوختوساز (متابولیسم) ماهیچه، بینایی، شبکۀ عصبی و اندازۀ بدن مرتبط بودند درحالیکه در اسبهای کرد با مسیر گیرندۀ جفتشونده با پروتئین G، رشد و بلوغ فیبرهای ماهیچه، تنظیم خون بندآوری (هموستازی) اکسیژن یاختهای، رنگدانهسازی در پوست و مو ارتباط داشتند.