پویش ژنگان کل برای تعیین جایگاههای تحت انتخاب مثبت در گوسفندان نژاد زندی
نویسندگان
1 استاد گروه علوم دامی، دانشکدۀ کشاورزی، دانشگاه تبریز
2 استادیار گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج
3 دانشجوی دکتری گروه علوم دامی، دانشکدۀ کشاورزی، دانشگاه تبریز
4 گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز.
5 استادیار گروه علوم دامی، دانشکدۀ کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک
doi
10.22059/ijas.2017.229950.653520چکیده
شناسایی مناطق ژنگانی (ژنوم) که هدف انتخاب بودهاند، یکی از راهکارهای اصلی تحقیقات زیستی است. هدف این پژوهش، پویش کل ژنگان برای شناسایی مناطقی از ژنگان گوسفندان نژاد زندی که در طی سالهای مختلف هدف انتخابهای طبیعی یا مصنوعی قرار گرفتهاند، بود. بدین منظور 96 رأس گوسفند نژاد زندی با استفاده از آرایههای ژنگانی Illumina ovine SNP50K BeadChip تعیین ژنوتیپ شدند. برای شناسایی نشانههای انتخاب بر پایۀ روشهای نداشتن تعادل پیوستگی (لینکاژی) از آزمون (iHS)integrated haplotype score استفاده شد. نتایج یازده منطقۀ ژنگانی روی کروموزومهای 1 (2 منطقه)، 3، 6، 7، 8، 9، 10، 17، 22 و 26 را شناسایی کرد. تجزیهوتحلیل دادههای زیستی (بیوانفورماتیکی) نشان داد، برخی از این مناطق ژنگانی بهطور مستقیم و غیرمستقیم با ژنهای مؤثر بر سازگاری (آداپتاسیون) به آبوهوای گرم و خشک (DNAJB4، HSPA4L، MSRB3)، پاسخ ایمنی (IL23A، STAT6، LY96)، توسعه و اندازۀ بدن (STAC3، LAP3)، توسعۀ نظام ساختار بدنی یا اسکلتی (SPP1، MEPE، IBSP) و سوختوساز (متابولیسم) انرژی (ATP5B، GLS2، CS) همپوشانی دارند. درنهایت بررسیQTLهای گزارششده در ژنگان گوسفند نشان داد، این مناطق با QTLهای صفات مهم اقتصادی از جمله صفات مرتبط با رشد، لاشه و پشم در ارتباط است. بههرحال، برای شناسایی دقیق این ژنها و QTLها لازم است بررسیهای پیوستگی و عملکردی بیشتری انجام شود.