فراتحلیل (متا-آنالیز) داده‌های بیان ژن بافت پستان آلوده‌شده با باکتری اشریشیاکلی در گاوهای شیری

نویسندگان

1 دانشیار، دانشکده کشاورزی، دانشگاه صنعتی اصفهان، اصفهان

2 دانشجوی دکتری، دانشکده کشاورزی دانشگاه صنعتی اصفهان، اصفهان

3 دانشیار، گروه بیوتکنولوژی دانشگاه شیراز و عضو گروه تحقیقاتی دانشگاه آدلاید- استرالیا

doi
10.22059/ijas.2017.232123.653524
چکیده

تشخیص ژن‌های درگیر در صفات پیچیده مانند حساسیت به بیماری نه تنها می‌تواند موجب بهبود تشخیص و پیشگیری از بیماری مورد نظر می‌شود، بلکه در انتخاب راه‌های درمانی کارآمد و همچنین در انتخاب دام‌های مقاوم به اصلاحگران کمک خواهد کرد. در این تحقیق با هدف بالا بردن توان تجزیۀ آماری در شناسایی ژن‌ها و مسیرهای زیستی (بیولوژیکی) درگیر در بیماری ورم پستان، از فراتحلیل به روش Fisherبرای یکی کردن p-value‌های به‌دست‌آمده از تجزیۀ انفرادی داده‌های شش بررسی‌ ریزآرایه که بیان ژن بافت پستان هنگام درگیری با باکتری اشریشیاکلی (E. coli) در گاوهای شیری را بررسی کرده بودند، استفاده شد. شناسایی ژن‌هایی که در هیچ‌یک از بررسی‌های انفرادی معنی­دار نشده بودند می­تواند تأییدکنندۀ هدف بیان شده باشد که منجر به ارائۀ مجموعۀ کامل‌تری از مسیرهای زیستی مرتبط با سامانۀ ایمنی، التهاب، تجزیۀ پروتئین (پروتئولیز) و مسیرهای مرتبط با رشد و افزونش و مرگ یاخته‌ای شد."کنترل مثبت بیان پروموتور RNA پلیمراز II"مسیر جدیدی در رابطه با این بیماری است که با وجود در بر گرفتن بیشترین شمار ژن در این بررسی‌، در بررسی‌های گذشتۀ مرتبط با ورم پستان گزارش نشده است.