برآورد اندازۀ مؤثر جمعیت در گاو سرابی بر اساس نشانگرهای چندشکل تک‌نوکلئوتیدی

نویسندگان

1 دانشیار گروه علوم دامی، دانشکدۀ کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان

2 دانشجوی دکتری ژنتیک و اصلاح نژاد دام دانشکدۀ کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان و عضو انجمن پژوهشگران جوان، دانشگاه شهید باهنر کرمان

3 دانشیار گروه علوم دامی، دانشکدۀ کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان

doi
10.22059/ijas.2015.56427
چکیده

این مطالعه با هدف برآورد اندازۀ مؤثر تعداد افراد در حال جفت‌گیری در جمعیت گاو سرابی با روش هتروزیگوسیتی اضافی و بر پایۀ استفاده از نشانگرهای متراکم چندشکل تک‌نوکلئوتیدی انجام گرفت. بدین منظور از 20 رأس گاو سرابی نمونه‌برداری شد. تعیین ژنوتیپ نمونه‌ها با چیپ Illumina High-density Bovine BeadChip شامل 777962 جایگاه SNP صورت گرفت. متوسط هتروزیگوسیتی مورد انتظار، متوسط هتروزیگوسیتی مشاهده‌شده، متوسط فراوانی آلل‌های نادر و درصد آلل‌های در حالت عدم تعادل هاردی-وینبرگ در مجموعۀ داده‌ها برآورد شد. اندازۀ مؤثر تعداد افراد در حال جفت‌گیری بر اساس روش هتروزیگوسیتی اضافی و به کمک نرم‌افزار NEESTIMATOR (v2) به ازای هریک از کروموزوم‌ها جداگانه برآورد شد. متوسط اندازۀ مؤثر برآوردشده، 28 فرد بود و متوسط فاصلۀ اطمینان 95% برای این برآوردها 3/17 تا 2/40 به دست آمد. نتایج مطالعه نشان داد که گاو بومی سرابی در معرض خطر جدی انقراض قرار دارد و تدوین برنامه‌هایی برای حفاظت از گاوهای خالص باقی‌مانده ضروری است.