بررسی بیوانفورماتیکی اثر ترکیبات گیاهان رزماری، آویشن شیرازی و نعناع فلفلی بر تشکیل بیوفیلم باکتری سودوموناس آئروژینوزا با استفاده از روش داکینگ مولکولی

نویسندگان

1 دانشیار، گروه زیست‌شناسی، دانشکده علوم دانشگاه رازی، کرمانشاه، ایران

2 دانشیار، گروه زیست‌شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه رازی، کرمانشاه، ایران

3 دانشجوی کارشناسی ارشد، گروه زیست‌شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه رازی، کرمانشاه، ایران

4 دانشیار گروه میکروبیولوژی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی کرمانشاه، کرمانشاه، ایران

doi
10.22084/ab.2023.22909.1445
چکیده

امروزه باتوجه‌به خطر گسترش مقاومت آنتی‌بیوتیکی، بار دیگر گیاهان به‌عنوان جایگزین‌هایی طبیعی برای مقابله با عفونت‌های باکتریایی مورد‌توجه ویژه قرار گرفته‌اند. یکی از محدودیت‌های مطالعات انجام شده روی خواص ضدباکتریایی عصاره‌های گیاهی عدم‌تعیین ترکیب فیتوشیمیایی دقیقی است که مسئول خاصیت ضدباکتریایی است. بر این اساس، هدف مطالعه حاضر بررسی بیوانفورماتیکی اثر ترکیبات فیتوشیمایی گیاهان رزماری، آویشن شیرازی و نعناع فلفلی از خانواده نعناعیان روی تشکیل بیوفیلم باکتری Pseudomonas aeruginosa است تا مشخص شود کدام ترکیب فیتوشیمیایی در این گیاهان مسئول مهار تشکیل بیوفیلم در این باکتری است. برای انجام داکینگ مولکولی از نرم‌افزارPyRx software 0.8  استفاده شد. نتایج داکینگ مولکولی نشان داد که ترکیبات فیتوشیمیایی این گیاهان به پروتیین ضروری  LasR متصل شده و آن را مهار می‌کنند. براساس نتایج داکینگ مولکولی سه ترکیب Borneol، Linalool و Dihydrocarvone گزارش شده از گیاهان آویشن شیرازی، رزماری و نعناع فلفلی تمایل بالایی برای اتصال به جایگاه فعال پروتیین LasR نشان دادند و می توانند نامزد ضد Pseudomonas aeruginosa باشند.