بررسی الگوهای ساختاری در شبکه بیان ژنی بیماران وسواسی
نویسندگان
1 استادیار، گروه زیستشناسی، واحد دزفول، دانشگاه آزاد اسلامی، دزفول، ایران
2 استادیار، گروه زیستشناسی، واحد دزفول، دانشگاه آزاد اسلامی، دزفول، ایران.
3 استادیار، گروه زیستشناسی، واحد دزفول، دانشگاه آزاد اسلامی، دزفول، ایران
doi
10.48305/jims.v43.i813.0429چکیده
مقاله پژوهشی مقدمه: اختلال وسواس، یک وضعیت روانپزشکی چندوجهی است که با افکار مزاحم و رفتارهای اجباری مشخص میشود. عوامل ژنتیکی، یکی از علل اصلی ایجادکنندهی این اختلال میباشد. این مطالعه با بررسی الگوهای ساختاری در شبکهی بیان ژن بیماران، از یک تحلیل شبکه هم بیان ژن وزنی جامع (WGCNA) برای روشن کردن مکانیسمهای مولکولی زیربنایی این اختلال استفاده میکند. روشها: این مطالعه بصورت تحلیلی بر روی دادههای بیان ژنی در بیماران دچار اختلال وسواس در مقایسه با گروه شاهد (افراد سالم) انجام گردید. برای این منظور پس از جستجو در پایگاههای دادههای بیوانفورماتیکی NCBI، Genercards، Swiss-Prot وDiseasome ژنهای دخیل در بیماری را که بر اساس حداقل یکی از روشهای in vivo، in vitro و in silico پیشنهاد شدهاند، استخراج و به عنوان ژنهای کاندید در نظر گرفته شد. سپس از مطالعات in vivo، in vitro و نیز in silico دادههای بیانی جمعآوری گردید و شبکههای ارتباطی از دادهای بیانی ژنهای کاندید به کمک نرمافزار MATLAB و R رسم شد. یافتهها: بر اساس نتایج تحلیل شبکه ارتباطی پروتئینهای کاندید، به کمک 5 شاخص مؤلفهی بیشترین میزان همسایگی، درجه، بین، نزدیکی و شعاع به ترتیب 6 پروتئین SOX9، ACAN، RUNX2، COL1A1، COL2A1 و MMP13 بیشترین میزان تکرار و تأیید توسط این 5 شاخص را داشتند. نتیجهگیری: الگوهای ساختاری در شبکهی بیان ژن نشان داد که ژنهای SOX9، ACAN، RUNX2، COL1A1، COL2A1 و MMP13 در بیماران وسواسی دارای اهمیت ویژهای نسبت به سایر ژنهای کاندید هستند. این موضوع میتواند در تهیه و آنالیز پانل ژنتیکی تشخیصی این اختلال کمککننده باشد.