تنوع نوکلئوتیدی ژن β-ocimen Syntethase در ژنوتیپهای حساس و مقاوم لوبیا به کنه تارتن دولکهای (Tetranychus urticae)
نویسندگان
1 دانشیار، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ایلام، ایلام، ایران
2 دانشآموخته کارشناسی ارشد، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ایلام، ایلام، ایران
3 دانشیار، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ایلام، ایلام، ایران
doi
10.22084/ab.2022.23219.1451چکیده
برگهای گیاهان در اثر صدمه گیاهخواران تولید ترکیب β-ocimen میکنند و آنزیم β-ocimen syntethase (OS) تولیدکننده آن است. توالی ژن OS در بانک های اطلاعاتی برای لوبیا وجود ندارد. تنوع نوکلئوتیدی ژن OS در ژنوتیپهای مقاوم (ناز و KS41128) و حساس (اختر و G11867) لوبیا به کنه تارتن دولکهای موردبررسی قرار گرفت. بذور در گلدان کشت شدند و در مرحله 2-3 برگی DNA ژنومی استخراج گردید و PCR با یک جفت آغازگر اختصاصی انجام شد. محصولاتPCR توالییابی شدند و با توالیهای OS در پایگاه NCBI مقایسه و میزان شباهت آنها بررسی گردید. توالییابی DNA نشان داد ژنوتیپهای ناز و KS41128 بیشترین تشابه را داشتند. آنالیز فیلوژنتیکی نشان داد ژنوتیپهای موردمطالعه در یک گروه و نمونههای NCBI در گروه دیگر قرار گرفتند. همچنین، نمونههای حساس و مقاوم از همدیگر تفکیک شدند. توالی این ژن در ژنوتیپها چندشکلی تک نوکلئوتیدی نشان نداد که نشاندهنده حفاظت این ناحیه از ژن در لوبیا است.