فهرست نشریات علمی دسترسی آزاد ایران

در این تحقیق آلودگی مزارع لوبیا در برخی از مناطق مهم استان زنجان به ویروس موزائیک زرد لوبیا (Bean yellows mosaic virus, BYMV) بررسی شد و روابط تبارزایی و جمعیتی جدایه‌های ایرانی با سایر جدایه‌های دنیا تجزیه‌وتحلیل شد. به‌منظور ردیابی اولیه این ویروس از مزارع لوبیا استان در مناطق مختلف کشت لوبیا 156 نمونه برگی جمع‌آوری شد. استخراج RNA کل از 81 نمونه برگی منتخب براساس زمان، محل نمونه­برداری و علائم شدید انجام شد. سپس ژن پروتئین پوششی در آزمون RT-PCR با جفت آغازگرهای اختصاصی این ناحیه ژنومی تکثیر شد. نتایج واکنش زنجیره‌ای پلی‌مراز نشان داد قطعه مورد انتظار مربوط به ژن پروتئین پوششی ویروس موزائیک زرد لوبیا با حدود 900 جفت باز، در نه نمونه مشکوک تکثیر شد. پس از تعیین توالی دو قطعه تکثیر یافته به‌عنوان نماینده باتوجه به تفاوت در علائم، زمان و مکان نمونه‌برداری، آنالیز تبارزایی با استفاده از نرم‌افزار MEGA 7 و آنالیزهای جمعیتی توسط نرم‌افزارهای RDP4، DnaSP و SDT به‌ترتیب به‌منظور بررسی نوترکیبی، مؤلفه‌های مربوط به جمعیت ازجمله جهش‌ها و تنوع ژنتیکی انجام شد. رسم درخت تبارزایی نشان داد که جدایه‌های ردیابی شده در این تحقیق همراه با جدایه‌هایی از کره‌جنوبی، امریکا و استرالیا که دارای میزبان‌های متفاوتی هستند در یک خوشه قرار می‌گیرند. هم‌چنین بیش‌ترین فاصله ژنتیکی جدایه‌های ایرانی با جدایه‌هایی از استرالیا و ژاپن مشاهده شد. نتایج نشان داد که بیش‌ترین نسبت جهش‌های غیرهم‌نام به جهش‌های هم‌نام مربوط به شاخه شماره یک است و هم‌چنین بیش‌ترین تنوع نوکلئوتیدی و کم‌ترین π نیز مربوطه به این گروه است که جدایه‌های ایرانی نیز در این گروه قرار دارند. در سایر خوشه‌ها قرار گرفتن جدایه‌ها همبستگی بیش‌تری ازنظر میزبانی و جغرافیایی داشتند.