شناسایی و جایگاه فیلوژنتیکی باسیلوس‌های مهم آنتاگونیست Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum

نویسندگان

1 استادیار، گروه گیاه‌پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد ورامین- پیشوا، ورامین، ایران

2 دانشجوی کارشناسی‌ارشد، گروه گیاه‌پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه آزاد اسلامی واحد ورامین- پیشوا، ورامین، ایران

3 استاد، گروه گیاه‌پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلی‌سینا، همدان، ایران

doi
10.22084/ab.2021.15965.1375
چکیده

میکروارگانیسم‌های فراریشه گوناگون بوده و می‌توانند برای کمک به سلامتی گیاه به کار گرفته شوند. سیب‌زمینی از گیاهان مهم است که ریشه آن با باکتری‌های فراوانی به‌ویژه جنس باسیلوس هم‌سازی دارد. برای رسیدن به این هدف از ریزوسفر بوته‌های سالم و شاداب سیب‌زمینی استان همدان نمونه‌برداری و تعداد 43 استرین گرم مثبت دارای فعالیت کاتالازی جدا شد. توان بازداری از رشد Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum  توسط استرین‌های جدا شده روی محیط‌کشت آگار غذایی به روش کشت سه نقطه‌ای و اندازه‌گیری هاله بازدارنده در قالب طرح کاملاً تصادفی بررسی شد. نتایج نشان داد که 11 استرین قادر به تولید هاله بازدارنده بوده و در سطح یک درصد دارای تفاوت معنی‌دار هستند که شامل هشت گروه آماری بودند. استرین B57 با 6/3 سانتی‌متر میانگین قطر هاله بازدارنده و استرین B4 با 16/1 سانتی‌متر میانگین قطر هاله بازدارنده، به‌ترتیب بیش‌ترین و کم‌ترین بازدارندگی از رشد را داشـتند. استـرین‌های باسیـلوس آنتاگونیست براسـاس ویژگـی‌های فنوتیپـی وابـسته به گونـه‌های Bacillus subtilis، B. cereus و B. pumilus بودند. بررسی‌های مولکولی بر پایه توالی‌یابی ناحیه 16S rDNA نیز نتایج ویژگی‌های فنوتیپی را تأیید کرد. جایگاه فیلوژنتیکی استرین‌های به‌دست‌آمده از این پژوهش شامل استرین B34 با 100 بوت استرپ در کلاستر B. Cereus ، استرین B7 با 100 بوت استرپ در کلاستر B. subtilis و استرین B57 با 100 بوت استرپ در کلاستر B. Pumilus قرار گرفت. شماره دستیابی به توالی ژن 16S rDNA در بانک ژن سایت NCBI  برای استرین‌های B7، B34 و B57 به‌ترتیب MG654658، MG654659 و MG654660 است. باتوجه به نتایج پژوهش مزبور یکی از عوامل میکروبی که در ریزوسفر بوته‌های سیب‌زمینی از استقرار بیمارگرهایی مانند باکتری‌های عامل پوسیدگی نرم جلوگیری می‌کند تنوع باسیلوس‌های این منطقه است.