بررسی تنوع ژنتیکی و روابط فیلوژنتیکی چند ژنوتیپ بومی و غیربومی لوفا با استفاده از نشانگر مولکولی rbcL
نویسندگان
1 دانشجوی کارشناسیارشد، گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، زابل، ایران
2 دانشیار، گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان، گرگان، ایران
3 استادیار، پژوهشکده بیوتکنولوژی، دانشگاه ساری، ساری، ایران
4 استادیار، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، زابل، ایران
doi
10.22084/ab.2021.22049.1437چکیده
در این تحقیق تنوع ژنتیکی نه ژنوتیپ مختلف بومی و غیربومی لوفا با نام علمی Luffa cylindrical از طریق ارزیابی توالی ژن کلروپلاستی rbcL موردبررسی قرار گرفت. پس از استخراج DNA و PCR با استفاده از پرایمرهای اختصاصی ژن rbcL، محصولات تکثیر شده توالییابی شد و همردیفسازی شده و دندروگرام روابط فیلوژنیک ترسیم شدند. از مجموع 703 جایگاه شناسایی شده در این تحقیق، 179 جایگاه دارای حذف و اضافه (177 مونومورف و 2 پلیمورف) و 524 جایگاه بدون حذف و اضافه بودند. همچنین مقدار متوسط عددی نسبت dN/dS حدوداً برابر با یک بود. در مجموع نتایج این تحقیق نشان داد بر اساس دندروگرام حاصل از تجزیه کلاستر و بررسی فواصل ژنتیکی نه تنها با کمک مارکر rbcL تنوع درون گونهای این گونه گیاهی بهخوبی قابل ارزیابیست بلکه این ژنوتیپها را میتوان بر اساس منطقه جغرافیایی نیز تا حدودی طبقهبندی کرد.
