فهرست نشریات علمی دسترسی آزاد ایران

پروتئین کینازکینازکینازهای فعال شونده با میتوژن (MAPKKK)، جز مهمی از آبشارهای پروتئین کیناز‌ها هستند که در پاسخ به انواع تنش‌های غیرزیستی و زیستی مانند حمله پاتوژن‌های گیاهی دخالت دارند. تحقیقات بسیاری بر روی ژن‌های MAPKKK گیاهان مختلف انجام شده ‌است، ولی تاکنون مطالعه جامعی در مورد روابط تکاملی، ساختار و الگوی بیان پروتئین‌های MAPKKK در سیب‌زمینی انجام نشده است. در مطالعه حاضر، 114 ژن کدکننده‌ی MAPKKK با استفاده از روش‌های بیوانفورماتیکی در ژنوم سیب‌زمینی شناسایی و براساس ارزیابی روابط فیلوژنتیکی به سه زیرخانواده RAF، ZIK و MEKK تقسیم شدند. تجزیه‌وتحلیل موتیف‌های محفوظ اعضای زیرخانواده‌های Raf، ZIK و MEKK گروه‌بندی درخت فیلوژنی را تأیید کرد. علاوه‌بر این، تجزیه‌وتحلیل پروفایل بیانی پروتئین‌های MAPKKK سیب‌زمینی نشان داد که این پروتئین‌ها در جریان بروز تنش‌های مختلف تنظیم می‌شوند. بررسی هشت ژن انتخابی براساس داده‌های RNA-Seq در تنش‌های گرما، سرما، شوری و تیمار Phytophthora infestans با استفاده از روش Real-time PCR، تغییرات سطح رونویسی بالایی را نشان دادند. این نتایج نشان می‌دهند که برخی از پروتئین‌های MAPKKK در سیب‌زمینی که در تنش‌ها غیرزیستی و زیستی مانند بیماری‌های قارچی تنظیم می‌شوند، می‌توانند انتخاب خوبی برای مطالعات بیش‌تر باشند.