تنوع ژنتیکی و صفات فیزیولوژیکی استرینهای Ralstonia solanacearum مزارع سیب زمینی استان همدان
نویسندگان
1 استاد بیماریشناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلیسینا، همدان
2 دانشجوی سابق کارشناسیارشد بیماریشناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلیسینا، همدان
doi
چکیده
بیماری پژمردگی باکتریایی ناشی از Ralstonia solanacearum از بیماریهای مهم سیبزمینی در استان همدان است. برای بررسی تنوع ژنتیکی جدایههای R. solanacearum نمونههای گیاهی مشکوک به آلودگی در بهار و تابستان سال 1389 از مناطق مختلف این استان جمعآوری گردید. کشت اندامهای آلوده گیاهی (غده و ساقه) روی محیط نوترینت آگار (NA) حاوی تری فنیل تترازولیوم کلراید و بررسی خصوصیات بیوشیمیایی و فیزیولوژیکی، منجر به شناسایی 52 استرین R. solanacearum بیوار A2 گردید. برای تشخیص دقیقتر جدایهها واکنش زنجیرهای پلیمراز با استفاده از آغازگرهای ps96H و ps96I انجام شد. نتایج PCR نشان داد که نمونهها همراه با نمونه استاندارد یک باند مشابه 148جفت بازی تولید نمودند. تنوع ژنتیکی 26 جدایه انتخابی با آغازگرهای BOX و ERIC مورد بررسی قرار گرفت. طول قطعات تکثیری با استفاده از آغازگر BOX A1R در محدوده 100 تا bp1500 و آغازگر ERIC از200 تا bp1200 متغیر بود. گروهبندی جدایههای بهدست آمده با روش UPGMA و براساس ضریب جاکارد با استفاده از دادههای هر دو آغازگـر، جـدایهها را در سطح تشابه 74 درصـد به 5 گروه اصـلی منتسب کرد. نتایج حاصل نشاندهـندهی آن است که استرینهای R. solanacearum جمعآوری شده خصوصیات فنوتیپی و ژنتیکی متفاوتی داشتند، هرچند ارتباط مشخصی بین منطقه جغرافیایی و خصوصیات استرینها بهدست نیامد. این بررسی کارآیی روشPCR با آغازگرهایBOX و ERIC را برای نشان دادن چندشکلی ژنتیکی در جمعیتهای R. solanacearum نشان داد.