الکتروفورز افقی پلیاکریلآمید با استفاده از چاهکهای ژلآگارز
نویسندگان
1 استادیار گروه بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی دانشگاه بوعلیسینا، همدان
2 دانشآموخته کارشناسیارشد گروه بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی دانشگاه بوعلیسینا، همدان
doi
چکیده
الکتروفورز افقی ژلآگارز، یکی از ابزارهای پایه در زیستشناسی مولکولی است. این روش آسان و سریع بوده، استفاده از آن نیاز به مهارت زیادی ندارد. یکی از معایب ژلآگارز این است که جداسازی قطعات کوچک DNA با تفاوتهای ناچیز در حد چند جفت باز و همچنین تفکیک قطعات کوچک مولکولهای DNA و پروتئین در این ژل بهخوبی امکانپذیر نیست که بهطور متداول در این موارد از ژل پلیاکریلآمید استفاده میشود. الکتروفورز عمودی ژل پلیاکریلآمید علیرغم مزایایی که دارد ولی روشی پیچیده، گران و زمانبر میباشد. اخیراً روشی برای الکتروفورز ژل پلیاکریلآمید بهصورت افقی معرفی شده است که ضمن داشتن مزایا نسبت به روش عمودی، ولی نیازمند ساخت دستگاهی جدید جهت انجام عمل الکتروفورز میباشد. در این پژوهش از دستگاه الکتروفورز افقی ژلآگارز با اندکی تغییرات، بهمنظور انجام الکتروفورز ژل پلیاکریلآمید برای قطعات DNA تکثیر شونده توسط نشانگرهای ریزماهوارهای استفاده شد. در این روش عمل الکتروفورز ژل پلیاکریلآمید، بهصورت افقی و با استفاده از ژل دو قسمتی آگارز و پلیاکریلآمید انجام شد. نتایج نشان داد باندهای حاصل از الکتروفورز کاملاً شفاف و واضح میباشند. همچنین در این روش، مشکلات تشکیل حباب در ژل و پارگی ژل، در هنگام جداسازی شیشه از ژل، وجود ندارد. دستگاه الکتروفورز معرفی شده، دو منظوره است که میتوان از آن هم برای ژل آگارز و هم برای ژل پلیاکریلآمید استفاده نمود.