تجزیه و تحلیل ژنتیکی و فیلوژنتیکی ناحیه HVR-I از ژنوم میتوکندری در گوسفند نژاد افشاری
نویسندگان
1 دانشجوی دکتری ژنتیک و اصلاح نژاد دام گروه علوم دامی دانشکده کشاورزی دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد
2 استاد گروه علوم دامی دانشکده کشاورزی دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد
3 دانشجوی دکتری ژنتیک و اصلاح نژاد دام، گروه علوم دامی دانشکده کشاورزی دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد
4 دانشیار گروه علوم دامی دانشکده کشاورزی دانشگاه شهرکرد، شهرکرد
5 دانشجوی کارشناسیارشد ژنتیک و اصلاح نژاد دام، گروه علوم دامی دانشکده کشاورزی دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد
doi
چکیده
خلوص ژنتیکی نژادهای گوسفند بهعلت تلاقیهای کنترل نشده دستخوش تغییر شده است، استفاده از نشانگرهای ژنتیکی توالییابی ژنوم میتوکندری، یکی از راههای بررسی این تغییرات است. هدف از این تحقیق بررسی میزان تنوع ناحیه HVR-I از ژنوم میتوکندری گوسفند نژاد افشاری میباشد. برای این منظور از تعداد 20 رأس گوسفندان افشاری غیرخویشاوند نمونه خون جمعآوری و پس از استخراج DNA از آنها، ناحیه موردنظر توسط پرایمرهای اختصاصی با تکنیک PCR، تکثیر و قطعات موردنظر توالییابی شدند. با تجزیه دادههای حاصل، تعداد 5 هاپلوتیپ در این جمعیت شناسایی شد. مقایسه توالی HVR-I گوسفند افشاری با توالی ناحیه مشابه از ژنوم گوسفندان سایر نژادها، مشخص کرد این نژاد متعلق به گروه هاپلوتیپی A میباشد، همچنین مقایسه توالی مذکور گوسفند افشاری با منطقه مشابه در گروه هاپلوتیپی A از ژنوم گوسفندان سایر نژادها، نشان داد که گوسفند افشاری داری کمترین فاصله ژنتیکی با نژاد بلوچی و مغانی ایران میباشد. همچنین تجزیه و تحلیل درخت فیلوژنی رسم شده برای گروه هاپلوئیدی A نشان داد که احتمالاً قوچ و میش اوریال بهعنوان منشا نژاد افشاری و دو نژاد دیگر گوسفند محسوب میشود.