آنالیز ترانسکریپتوم ژنهای القاء شده در پاسخ به تنش شوری در گیاه شورپسند Aeluropus littoralis
نویسندگان
1 استاد پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری کشاورزی طبرستان، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، مازندران
2 دانشجوی دکتری اصلاح نباتات، پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری کشاورزی طبرستان، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، مازندران
3 کارشناسارشد اصلاح نباتات، پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری کشاورزی طبرستان، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری،
4 استادیار گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده مهندسی انرژی و فناوریهای نوین،دانشگاه شهید بهشتی، تهران
doi
چکیده
شوری خاک با محدود کردن تولیدات گیاهی ابتدا جنبههای نموی را تحت تأثیر قرار میدهد که منجر به کاهش تولیدات گیاهی میگردد. در این تحقیق آنالیز بیان ژن مبتنی بر تکنیک cDNA-AFLP جهت مقایسه الگوی بیانی ناشی از تنش شوری در سه سطح 0 (شاهد)، 200 و 400 میلیمولار NaCl بهمدت 1 هفته پس از واکشت، در ریشه گیاه Aleuropus littoralis که نزدیکترین خانواده به غلات میباشد، انجام شد. از میان 32 عدد EST جداسازی شده از روی ژل پلیاکریلآمید، 25 عدد با طول میانگین 250 جفت باز توالییابی شدند. بهمیزان 80% از رونوشتهای توالییابی شده با توالی اسیدآمینه و اسیدنوکلئیک شناسایی شده در موجودات دیگر، شباهت نشان دادند. از طرفی دیگر، 7 رونوشت (EST) بهعنوان ژنهای جدید احتمالی در نظر گرفته شدند. در نهایت 25 عدد EST در بانک ژن به ثبت رسید که مهمترین آنها شامل گروههای پروتئینی انتقالدهنده پتاسیم، پروتئینهای ریبوزومی، NADH دهیدروژناز و گولگین میباشند. نتایج این تحقیق در درک پایههای مولکولی تنش شوری و مکانیسم مقاومت جهت اصلاح و مهندسی ژنتیک در بهبود مقاومت غلات در برابر این تنش و تولید گیاهان مقاوم کمک میکند.