شبیهسازی جمعیت اولیه (تاریخی) و تعیین صحت عدمتعادل پیوستگی در مطالعات شبیهسازی ژنومی
نویسندگان
1 دانشجوی دکتری ژنتیک و اصلاح نژاد دام، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج
2 استاد ژنتیک و اصلاح نژاد دام، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج
3 دانشیار ژنتیک و اصلاح نژاد دام، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج
4 استادیار ژنتیک و اصلاح نژاد دام، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج
doi
چکیده
جهت بررسی صحت عدمتعادل پیوستگی در مطالعات شبیهسازی ژنومی، جمعیتی در دو حالت عدمتعادل پیوستگی صفر و یک در نسل اول شبیهسازی شد. از معیارهای اندازه مؤثر جمعیت، میزان عدمتعادل پیوستگی و واریانس بین نشانگرها جهت تعیین صحت شبیهسازی استفاده شد. نتایج نشاندهنده همبستگی بالا بین اندازه مؤثر جمعیت مشاهده شده و مورد انتظار بود. همچنین میزان عدمتعادل پیوستگی مشاهده شده و مورد انتظار بر هم منطبق شدند و چنین روندی با افزایش اندازه جمعیت مؤثر وضعیت مطلوبتری پیدا کرد. بهعلاوه میزان واریانس مشاهده شده و مورد انتظار بین نشانگرها در حالت نوترکیبی آزاد نیز بر یکدیگر منطبق شدند. با توجه به معیارهای مورد بررسی میتوان گفت که جمعیت اولیه به درستی شبیهسازی شده است و میتوان از آن برای توسعه جمعیت مرجع استفاده کرد. با توجه به نتایج بهدست آمده پیشنهاد میشود در مطالعات شبیهسازی ژنومی پس از تشکیل جمعیت اولیه از معیارهای ارائه داده شده جهت بررسی صحت شبیهسازی استفاده شود.