همسانه¬سازی و بررسی ژنهای شبهسایکلوتاید در ذرت
نویسندگان
1 دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشگاه کردستان، سنندج
2 استادیار گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان، سنندج
3 دانشجوی کارشناسی ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشگاه کردستان، سنندج
doi
چکیده
سایکلوتایدها دستهای بزرگ از پپتیدهای حلقوی هستند که فعالیتهای زیستی متنوعی دارند. از جمله میتوان به فعالیت ضد میکروبی، ضدتوموری، ضدویروسی، تخریب گلبولهای قرمز، سلولکشی و حشرهکشی اشاره کرد. شبهسایکلوتایدها در گیاهان به صورت خانواده ژنی بیان شده و دارای نواحی حفاظت شده میباشند. در این پژوهش بر اساس توالی نواحی حفاظتشده پروتئین آغازگر طراحی شد و با استفاده از تکنیکRACE-PCR '3 ژنهای کدکننده پروتئینهای شبه سایکلوتاید در ذرت همسانه سازی و تعیین توالی شدند. مقایسه توالیهای بهدست آمده با توالیهای موجود در پایگاه دادههای ژنی PGI نشان داد که تعداد نه ژن شبهسایکلوتاید جدید در ذرت بهدست آمده است. مقایسه توالی نوکلئوتیدی و اسیدآمینهای این ژنها آنها را به دو دسته تقسیم کرد. دسته اول شباهت زیادی با سایر شبهسایکلوتایدهای موجود در پایگاه دادههای ژنی داشته و دارای نواحی حفاظت شده سایکلوتایدی بودند. دسته دوم دارای ساختار منظم سایکلوتایدی نبودند و تعداد نوکلئوتیدهای این دو دسته از 485-413 متغیر بود. این اولــین گزارش در زمینه همسـانهسازی ژنهای شبهسایکلوتاید در گرامینهها بود و نشان داد که ذرت تنوع بالایی از این ژنها دارد.