همسانه¬سازی مولکولی، جداسازی و توصیف یک ژن پکتات لیاز از بافت حبه انگور بی¬دانه سفید (Vitis vinifera L. cv. Bidaneh Sefid)

نویسندگان

1 دانشیار، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده فنی و مهندسی، دانشگاه بین المللی امام خمینی(ره)، قزوین

2 دانش آموخته کارشناسی ارشد، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده فنی و مهندسی، دانشگاه بین المللی امام خمینی(ره)، قزوین

3 دانش آموخته کارشناسی ارشد، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده فنی و مهندسی، دانشگاه بینالمللی امام خمینی (ره)، قزوین

4 استادیار، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده فنی و مهندسی، دانشگاه بین المللی امام خمینی(ره)، قزوین

5 استادیار، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده فنی و مهندسی، دانشگاه بینالمللی امام خمینی(ره)، قزوین

doi
چکیده

یکی از فعالیت­های مهم سلول­های گیاهی در دوره رشد آن، فعال نمودن ژن­های عامل و آنزیم­های موثر در تجزیه برخی مواد ذخیره شده در مراحل اولیه تشکیل میوه است. بر اساس مطالعات انجام شده، آنزیم­های مختلفی در تخریب دیواره سلولی و نرم شدن بافت میوه نقش دارند. از مهم­ترین این آنزیم­ها، آنزیم پکتات لیاز می­باشد. در این مطالعه، cDNA ناقص یکی از ژن­های پکتات لیاز از بافت حبه انگور بی­دانه سفید (Vitis vinifera L. cv. Bidaneh Sefid) با استفاده از تکنیک واکنش زنجیره­ای پلی­مراز نسخه­برداری معکوس (Reverse Transcriptase-PCR) جداسازی و در ناقل pUC19 همسانه­سازی و ساختار مولکولی، ویژگی­های بیوشیمیایی و فیلوژنتیکی آن مورد بررسی قرار گرفت. توالی نوکلئوتیدی این ژن، تحت عنوان VvPel1، به­طول  bp429 بوده و یک پروتئین با 143 اسیدآمینه را رمز می­کند. وزن مولکولی محاسبه شده و نقطه ایزوالکتریک پیش­بینی شده این پروتئین به­ترتیب برابر 78/15 کیلو دالتون و 53/6 می­باشد. بررسی ساختارهای دوم و سوم توالی پروتئینی VvPel1 نشان داد که این پروتئین از نظر ساختاری مشابه با توالی­های پکتات لیاز گزارش شده از موجودات دیگر می­باشد. توالی پروتئینی به­دست آمده شباهت زیادی را با توالی­های پکتات لیاز سایر گیاهان از قبیل Ricinus communis، Fragaria ananassa، Prunus persica و Populus trichocarpa نشان داد. بررسی فیلوژنتیکی نیز مشخص کرد که این ژن به زیرگروه I پکتات لیازهای گیاهی تعلق دارد.