بررسی کمی و کیفی DNA بلدرچین، استخراج شده با روش نمکی تغییر یافته و توالی¬یابی ژنومی آن
نویسندگان
1 استادیار گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلی سینا، همدان
2 استادیار گروه علوم دامی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران
3 استاد گروه علوم دامی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران
4 دانشیار گروه علوم دامی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران
5 دانشیار گروه علوم دامی پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران
6 استاد گروه ژنتیک و بیوتکنولوژی، دانشکده علوم و کشاورزی، دانشگاه آرهوس، دانمارک
doi
چکیده
استخراج DNA بهصورت خالص، پایدار و با کمیت و کیفیت مناسب، گام مهمی در اجرای پژوهشهای بیولوژیکی میباشد. در این پژوهش، DNA مربوط به نمونه خون 600 بلدرچین ژاپنی با روش نمکی تغییر یافته با پودر رختشویی و بدون استفاده از آنزیم پروتئیناز K استخراج شد. نمونههای DNA بهدست آمده در مراحل آمادهسازی کتابخانه ژنومی، با نانودراپ، فلئورومتر، بیوآنالیزر، الکتروفورز، PCR، هضم با آنزیمهای آندونوکلئاز، اتصال برچسب و آدابتور و در نهایت با توالییابی کل ژنوم کنترل کمی و کیفی گردید. متوسط مقدار DNA استخراج شده با متوسط میزان نسبت جذب نور در 260 به 280 نانومتر برای هر نمونه بهترتیب 138 میکروگرم و 87/1 بود. فرآیندهای تکثیر، هضم، اتصال برچسب و آدابتور و توالییابی ژنومی همه نمونههای DNA مورد استفاده با موفقیت کامل همراه بود. بر اساس نتایج مشخص شد که نمونههای مذکور از کمیت، کیفیت، قابلیت و پایداری لازم و حداقل آلودگی برخوردار بودند. این روش استخراج DNA به سادگی، سریع، ایمن و با حداقل هزینه انجام پذیرفت.
