الگوی rep-PCR استرین¬های Pectobacterium جدا شده از سیب¬زمینی دارای علایم بیماری-های پوسیدگی نرم و ساق سیاه در استان همدان

نویسندگان

1 دانشجوی سابق کارشناسی ارشد بیماری شناسی گیاهی دانشگاه آزاد دامغان

2 دانشیار گروه گیاه پزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلی سینا، همدان

3 مرکز تحقیقات جهاد کشاورزی استان همدان

4 بخش بیماری¬های گیاهی موسسه بررسی آفات و بیماری¬های گیاهی وزارت جهاد کشاورزی

doi
چکیده

استرین­های وابسته به باکتری جنس Pectobacterium از مهم­ترین عوامل بیماری­زای گیاهی به­ویژه سیب­زمینی هستند. در استان همدان همه ساله گونه­های مختلف این باکتری زیان­های فراوانی را به بار می­آورند. از مناطق مختلف کشت سیب زمینی در استان همدان نمونه­های مشکوک و دارای علایم بیماری­های پوسیدگی نرم و ساق سیاه گردآوری و استرین­های باکتریایی مشابه Pectobacterium رو ی محیط کشت EMB جدا و خالص سازی شدند. پس از اثبات بیماری­زایی استرین­های باکتری روی سیب­زمینی، تعداد 27 استرین برای بررسی ویژگی­های فنوتیپی به­منظور شناسایی، انتخاب شدند. استرین­های باکتریایی مورد بررسی بر اساس ویژگی­های بیماری­زایی و فنوتیپی از هم­دیگر متمایز بودند. بر مبنای ویژگی­های فنوتیپی بیشتر استرین­های عامل بیماری سیب­زمینی به­عنوان Pectobacterium carotovorum و تعدادی نیزPectobacterium atrosepticum شناسایی شدند. انگشت نگاری ﮊنومی استرین­های انتخاب شده به­روش rep-PCR  با استفاده از دو آغازگرERIC  وBox  انجام شد. داده­های به دست آمده با استفاده از نرم­افزار NTSYS V 2.2 و روش تجزیه خوشه­ای UPGMA آنالیز شد. نتایج حاصل نشان داد که استرین­های مورد آزمایش P. carotovorumو تعدادی نیز P. atrosepticum  هستند. بررسی الگوی  rep-PCRروشی سریع برای تشخیص و ردیابی استرین­های Pectobacterium بیماریزای سیب­زمینی است.