شناسایی، طبقهبندی و آنالیز بیان خانواده ژنی عوامل رونویسی DREB در گیاه آلوروپوس لیتورالیس (Aeluropus littoralis) تحت تنش شوری
نویسندگان
1 دانشجوی دکتری اصلاح نباتات، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
2 استادیار گروه مهندسی ژنتیک و بیولوژی، پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری کشاورزی طبرستان، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری.
doi
چکیده
خانواده ژنی DREB یک خانواده بزرگ از عوامل رونویسی است که نقشهای مهمی در تنظیم رشد گیاه و پاسخ به تنشهای محیطی خارجی ایفا میکنند. با توجه به تعیینتوالی ژنوم گیاه هالوفیت آلوروپوس لیتورالیس (Aeluropus littoralis) فرصتی برای آنالیز گسترده ژنومی ژنهای خانواده ژنی DREB، فراهم شد. در مجموع، 16 ژن غیر تکراری رمزکننده DREB در ژنوم آلوروپوس شناسایی شد. در این پژوهش، ساختارهای ژنی، روابط فیلوژنتیکی، ترکیب موتیفها و الگوهای بیان ژنهای DREB تحت تنش شوری و بازیابی، مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند. ساختار فیلوژنی نشان داد که ژنهای خانوادة ژنیDREB آلوروپوس بر مبنای همولوژی با گیاه مدل آرابیدوپسیس تالیانا به 5 گروه A1، A2، A4، A5 و A6 تقسیمبندی شدند. آنالیز ساختارهای ژنی و ترکیب موتیفها نشان داد که این ژنها در هر گروه از حفاظتشدگی بالایی برخوردار بوده که احتمالاً حاکی از کارکردهای مشابه اعضای هر گروه میباشد. بر اساس دادههای تعیینتوالی RNA ، ژنهای AlDREB6.3 و AlDREB6.2، ببیشترین بیان را در شرایط تنش شوری در بافت ریشه به نمایش گذاشتند. بیشترین کاهش بیان نیز در ژنهای AlDREB6.4 و AlDREB6.3، در شرایط بازیابی در بافت برگی مشاهده شد. نتایج این تحقیق میتواند پایهای برای تجزیه و تحلیل کارکردی ژنهایDREB آلوروپوس برای درک نقشهای زیستشناختی آنها فراهم آورد.