فهرست نشریات علمی دسترسی آزاد ایران

ژن چالکون سنتتاز(CHS) یکی از ژن های کلیدی در مسیر بیوسنتز فلاونوییدها در گیاهان است. این ژن کد کننده آنزیم چالکون سنتتاز می‌باشد که در مرحله ابتدایی مسیر بیوسنتز فلاونوییدها نقش مهمی دارد. ژن CHS علاوه بر نقش اصلی خود در بیوسنتز فلاونوییدها ممکن است در مسیرهای متابولیکی دیگری مانند تولید ترکیباتی که پیش ساز کانابینوییدها ( مانند THC و CBD) هستند نیز دخالت داشته باشند. به دلیل اهمیت این ژن در گیاه شاهدانه این ژن به کمک پایگاه‌های مختلف اطلاعاتی و نرم افزارهای گوناگون بیوانفورماتیک مطالعه گردید. جست و جوی توالی نوکلوتید شماره دسترسی NM_001397940 گیاه شاهدانه در پایگاه اطلاعاتی NCBI توانست 100 تطابق را نشان دهد. همردیفی توالی پروتیینی با شماره دسترسی NP_001384869.1 در گیاه شاهدانه مقابل پایگاه اطلاعاتی NCBI توانست 100 تطابق را نشان دهد. بیشترین امتیاز Max Score (805) متعلق به همردیفی با NP_001384869.1 از خود گیاه شاهدانه با 100% پوشش و 100% شباهات بود. کمترین Max Score (746) مربوط به همردیفی با QRV61377.1 از گونه Litchi chinensis با 99% پوشش و 92.01% شباهات بود. مقدار E-Value در این بخش نیز برای تشخیص معناداری تطابق ها مورد استفاده قرار گرفت. آنالیز فیلوژنتیکی 20 گونه اول که در آنالیز BLAST n با ژن CHS همولوژی نشان داده بود دندرومی ایجاد کرد که گونه‌های مورد مطالعه را در 6 گروه مجزا دسته‌بندی کرد. آنالیز تنوع ژنتیکی توسط نرم افزار MEGA 6 نشان داد که در حدود 31 درصد از طول توالی ژن CHS جهش‌‌‌های نوع جایگزینی رخ داده است.