ژنهای خانواده FAD در گستره ژنوم ریزجلبک اسپیرولینا (Arthrospira platensis) و بررسی عملکردهای سلولی در پاسخ به تنشهای غیر زیستی
نویسندگان
1 استاد، گروه مهندسی ژنتیک و بیولوژی، پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری کشاورزی طبرستان، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ایران
2 دانشیار، گروه اصلاح نباتات، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ایران
3 دانشکده علوم زراعی، گروه اصلاح نباتات، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
4 گروه مرکبات و گیاهان دارویی، پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری کشاورزی طبرستان، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ایران
doi
10.30473/cb.2024.70853.1963چکیده
ریزجلبک Arthrospira platensis یک پروکاریوت فتوسنتزکننده ارزشمند با مصارف صنعتی و غذایی متعدد میباشد. آنزیمهای اسید چرب دساچوراز (FADs) مسئول تولید اسیدهای چرب غیراشباع تک و چندگانه هستند. در مطالعه حاضر با استفاده از راهکارهای بیوانفورماتیکی، ژنوم A. platensis C1 به منظور شناسایی ژنهای خانواده ApFAD بررسی شد. تعداد 8 ژن ApFAD در ژنوم اسپیرولینا شناسایی و به گروههای Omega، Sphingolipid، CrtR_beta-carotene-hydroxylase و Acyl-CoA، طبقهبندی شدند. چهار موتیف هیستیدینی حفاظت شده که برای اتصال به ساختارهای دای-آهن و فعالیتهای کاتالیزوری ضروری هستند، شناسایی شدند. بررسی تغییرات پس از ترجمه پروتئینهای ApFAD طیف گستردهای از تغییرات گلیکوزیلاسیون و فسفریلاسیون را نشان داد. بررسی نواحی پروموتری ژن FAD انواع مختلفی از عناصر تنظیمی سیس پاسخگو به فیتوهورمونها و شرایط تنش، بهویژه در دساچورازهای امگا (ApFAD-6) و آسیل-لیپید (ApFAD-3) را نمایان ساخت. همچنین، شبکههای برهمکنش پروتئین-پروتئین تعامل بین ApFADها و ژنهای دخیل در مقابله با تنش به واسطه فرآیند بیوسنتزی متابولیتهای ثانویه و نیز انتقال الکترون را نشان دادند. آنالیز دادههای RNA-seq ژنهای ارتولوگ در آرابیدوپسیس، پتانسیل ژنهای گروه امگا و آسیل-لیپید در اسپیرولینا، مانند ژنهای ApFAD-3، ApFAD-6 و ApFAD-7، را در پاسخ به تنشهای محیطی مختلف نشان داد. بطورکلی، نتایج این تحقیق میتواند به درک و شناخت کاملتر عملکرد ژنهای FAD در اسپیرولینا کمک کرده و زمینه را برای دستورزی این ژنها با هدف افزایش محتوای اسیدهای چرب غیراشباع و بهبود ارزش تغذیهای روغنها و نیز افزایش تحمل گیاهان به تنشهای محیطی مختلف فراهم نماید.