بررسی ساختار و تنوع ژنتیکی جمعیت اسب کاسپین با استفاده از اطلاعات میکروستلایت

نویسندگان

1 دانشیار، بخش بیوتکنولوژی، موسسه تحقیقات علوم دامی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران.

2 استادیار، بخش علوم دامی، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی صفی‌آباد-دزفول، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، دزفول، ایران.

3 دکتری، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان، سنندج، ایران.

4 استادیار، بخش ژنتیک و اصلاح نژاد دام و طیور، موسسه تحقیقات علوم دامی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران.

doi
10.22092/asj.2024.365773.2391
چکیده

هدف از انجام این تحقیق بررسی ساختار و تنوع ژنتیکی با کمک آنالیز توالی‌های تکرارشونده کوتاه در جمعیت اسب کاسپین ایران بود. برای انجام این تحقیق از اطلاعات 17 جایگاه STR بدست آمده از 514 اسب کاسپین استفاده گردید. برای تمامی جایگاه‌های STR مورد مطالعه فراوانی آللی، هتروزیگوسیتی مشاهده شده و مورد انتظار، غنای آللی، میزان کمبود هتروزیگوت در جمعیت (F_is)، محتوای اطلاعات چند شکلی، آزمون هاردی-واینبرگ، تنوع ژنی ، محاسبه گردید. همچنین در این مطالعه اندازه‌ی موثر جمعیت (Ne) برای نسل حال حاضر با کمک یک برآوردگر تک جمعیتی بر پایه‌ی اطلاعات LD با در نظر گرفتن حدآستانه های مختلف جهت حذف آلل‌های کمیاب محاسبه گردید. نتایج نشان داد که تنوع آللی مشاهده شده برای جایگاه های STR در جمعیت کاسپین بسیار بیشتر از آن مقداری بوده که قبلا تصور می‌شد. همچنین روند تغییرات میزان هموزایگوستی در سال های اخیر افزایشی بوده که احتمالا به دلیل تلاقی‌های بیشتر در بین افراد خویشاوند می‌باشد. میزان Ne برآورد شده بین 5/84 (با حذف آلل هایی با فراوانی کمتر از 05/0 درصد) تا 6/139 (بدون حذف آلل‌ها) متغیر بود. نتایج این مطالعه نشان داد که وضعیت تنوع ژنتیکی این جمعیت در شرایط مطلوبی نبوده و برای حفظ این تنوع، می‌بایست برنامه‌های حفاظتی و تلاقی‌های کنترل شده اجرا گردد.