اثر ژنوتیپ گیاه و مکان جغرافیایی بر روی فراوانی باکتری اندوفیت متیلوباکتریوم در میوه دو رقم توتفرنگی
نویسندگان
1 دانشآموخته ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشگاه کردستان، سنندج
2 دانشیار بیماریشناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان، سنندج
3 دانشآموخته ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشگاه کردستان، سنندج
4 دانشیار بیوتکنولوژی گیاهی، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان، سنندج
doi
10.22092/sbj.2021.126700.164چکیده
اندوفیت به گروهی از میکروارگانیسم ها اطلاق میگردد که در قسمتهای داخلی بافتهای گیاهان زندگی نموده و بر بسیاری از خصوصیات گیاه میزبان تأثیر میگذارند. گونههای مختلف باکتری اندوفیت متیلوباکتریوم در سنتز کاراتنوئیدها، تولید ترکیبات فنولی و فرار، همچنین در افزایش سطح تولید اجزای سازنده عطر و طعم در میوه مؤثر میباشند. تنوع و فراوانی این باکتریها تحت تأثیر ژنوتیپ گیاه میزبان، شرایط اقلیمی و خاک میباشد. این مطالعه به منظور جداسازی باکتریهای جنس متیلوباکتریوم از دو رقم توتفرنگی در مناطق مختلف استان کردستان انجام شد. در این پژوهش باکتریهای اندوفیت از میوه دو رقم توتفرنگی کردستان و پاروس جمعآوری شده از سه منطقه انگوژان، گاورود و نشور در استان کردستان جداسازی شدند. شناسایی جدایه های باکتری براساس تعیین توالی ژن 16S rDNA انجام گردید. بدین منظور پس از استخراج DNA ژنومی جدایهها، ژن 16S rDNA به روش PCR تکثیر و پس از تعیین توالی میزان شباهت توالیهای به دست آمده با توالی نوکلئوتیدی ژن 16S rDNA سایر باکتریهای مرجع با استفاده از نرم افزار Blastn محاسبه گردید. سپس جمعیت جدایههای باکتری در زمانهای (مراحل) مختلف رسیدگی میوه تعیین گردید. نتایج به دست آمده نشان داد که باکتری جدا شده در هر دو رقم کردستان و پاروس متعلق به جنس متیلوباکتریوم (Methylobacterium) می باشد. جمعیت باکتریهای متیلوباکتریوم در ارقام مورد مطالعه در مناطق مشابه از لحاظ آماری متفاوت بود. رقم کردستان در مقایسه با رقم پاروس، در هر سه منطقه برتری معنیداری از لحاظ جمعیت باکتری نشان داد (p< 0.05). بیشترین جمعیت باکتری در هر دو رقم و در مناطق جغرافیایی مورد مطالعه در مرحله رسیدگی میوه محاسبه گردید. با توجه به تفاوت دو رقم گیاه از لحاظ عطر و طعم و همچنین تفاوت معنیدار جمعیت باکتری احتمال تأثیر این باکتریها در عطر و طعم این دو رقم وجود دارد.