ارزیابی آلودگی ویروسی بر پایه شناسایی الگوی تغییرات بازتابش طیفی در گیاهان دختری سیب زمینی بذری
نویسندگان
1 موسسه تحقیقات ثبت و گواهی بذر و نهال
2 موسسه تحقیقات ثبت و گواهی بذر و نهال
3 معاون تحقیقات کنترل و گواهی بذر
4 موسسه تحقیقات ثبت و گواهی بذر و نهال
5 دانشجوی دکتری، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی دانشگاه گیلان، رشت، ایران مربی پژوهش، موسسه تحقیقات ثبت و گواهی بذر
doi
10.22092/ijsst.2020.342734.1336چکیده
تشخیص دقیق و سریع گیاهان آلوده یک فرایند ضروری در سیستم گواهی بذر سیبزمینی به شمار می رود. انگشت نگاری طیفی به عنوان روش غیرتخریبی و سریع برای تشخیص گیاهان بیمار یا تحت استرس، در حال توسعه می باشد. تحقیق حاضر با استفاده از دادههای طیف سنجی به تشخیص بوتههای آلوده سیبزمینی (که به طور همزمان به دو ویروس PVY و PLRV آلوده بودند) بدون هرگونه فرایند تخریبی پرداخته است. داده-های طیفی از 32 گیاه ( 16 گیاه آلوده و 16 گیاه سالم) که وضعیت آلودگی یا سلامت آنها با استفاده از آزمون ELISA و RT-PCR محرز شده بود، برداشت گردید. قبل از مدلسازی به منظور حذف سیگنالهای ناخواسته از روش پیشپردازش دادههای طیفی (Multiplicative scatter correction) و سپس روش طبقه-بندی Soft Independent Modeling of a Class Analogy (SIMCA) استفاده شد. در این بررسی هیچ نمونهای به طبقه اشتباه یا به طور هم زمان به دو طبقه تعلق نگرفت که حاکی از پتانسیل قابل قبول این روش طبقهبندی در تمایز گیاهان آلوده به ویروس است. نتایج نشان داد طول موجها به ترتیب در سه محدوده 910- 863 نانومتر (جزء محدوده طیفی مادون قرمز نزدیک)، 725-704 نانومتر(جزء محدوده لبه قرمز) و 580-530 نانومتر (جزء محدوده سبز) بیشترین مشارکت را در تمایز گیاهان آلوده و سالم و تفکیک مدلهای مرتبط با آن داشتهاند.