شبیهسازی دینامیک مولکولی اضافه شدن رشتهی PAS به داروی پپتیدی G-CSF و پیشنهاد توالی جدید برای رشتهی PAS به منظور بهبود عملکرد داروی مورد نظر
نویسندگان
1 کارشناس ارشد مهندسی مکانیک، گروه تبدیل انرژی، دانشکدهی مهندسی مکانیک، دانشگاه صنعتی شریف، تهران
2 دانشیار، گروه تبدیل انرژی، دانشکدهی مهندسی مکانیک، دانشگاه صنعتی شریف، تهران
doi
10.22041/ijbme.2018.81637.1324چکیده
در مطالعات اخیر، PASylation به عنوان یک روش موثر به منظور افزایش نیمهعمر داروهای پروتئینی و جایگزینی مناسب برای PEGylation مطرح شده است. در این روش، یک رشتهی به مراتب زیستسازگارتر و متشکل از پلیمرهای طبیعی، شامل پرولین، آلانین و سرین، که به اختصار به آن رشتهی PAS گفته میشود، برای بهبود مشخصههای دارو مورد استفاده قرار میگیرد. در این مقاله، برخی از مشخصههای داروی G-CSF، نظیر میانگین توانی فاصلهی اتمی (RMSD)، حجم هیدرودینامیکی، انرژی کل و میزان آبدوستی پروتئین مورد بررسی قرار گرفته است. در این راستا، خواص مختلف داروی پروتئینی متصل به رشتهی PAS برای سه طول مختلف رشتهی مورد نظر (طولهای 210، 420 و 630) مورد بحث و بررسی قرار گرفته است. نتایج به دست آمده بیانگر این نکته است که با اتصال رشتهی PAS به داروی پروتئینی، حجم هیدرودینامیکی آن افزایش یافته و به واسطهی آن نیمهعمر دارو نیز افزایش مییابد. در نهایت، با در نظر داشتن نتایج به دست آمده در این قسمت، یک توالی اصلاحشده برای رشتهی PAS مورد نظر پیشنهاد شده است.