بررسی ساختار و تنوع ژنتیکی جمعیت های کاج چلغوزه (Pinus gerardiana) افغانستان با استفاده از نشانگرهای مولکولی iPBS وSCoT
نویسندگان
1 دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهرکرد، شهرکرد
2 عضور هیات علمی/ دانشگاه شهرکرد
3 دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهرکرد، شهرکرد، ایران
doi
10.22092/ijrfpbgr.2023.361428.1433چکیده
چکیدهسابقه و هدف: کاج چلغوزه در نواحی شرق و جنوبشرق افغانستان رشد میکند و نقش مهمی در توسعه اجتماعی و اقتصادی جوامع روستایی دارد که در مجاورت جنگلهای چلغوزه زندگی میکنند و از آن به عنوان سوخت، گیاه دارویی، مرتع، پناهگاه دام و آجیلی استفاده میشود. در این مطالعه تنوع و ساختار ژنتیکی جمعیتهای این درخت با نشانگرهای SCoT و iPBS ارزیابی شد.مواد و روشها: در مجموع 39 ژنوتیپ کاج چلغوزه از مناطق مختلف در پنج استان افغانستان به نامهای خوست، پکتیا، لغمان، کنر و نورستان جمعآوری شد. برای استخراج DNA ژنومی، از روش CTAB اصلاح شده استفاده گردید. تعداد 6 آغازگر از هر نشانگر SCoT و iPBS برای این بررسی استفاده شد که بهترتیب تعداد 48 و 55 نوار SCoT و iPBS تولید کردند. برای تجزیهوتحلیل دادهها و تعیین روابط ژنتیکی، تجزیه خوشهای انجام شد.یافته ها: در این مطالعه از 12 پرایمر SCoT و iPBS استفاده شد که منجر به تولید 48 باند و 55 باند برای نشانگرهای SCoT و iPBS شد. درصد چندشکلی به ترتیب 8/20 و 1/29 برای نشانگر SCoT و iPBS برآورد شد. میانگین کل PIC به ترتیب 026/0 و 045/0 برای نشانگر SCoT و iPBS تعیین گردید که نشاندهنده تمایز بیشتر نشانگر iPBS نسبت به SCOT است. ضرایب شباهت ژنتیکی نشاندهنده تنوع ژنتیکی کم بینجمعیتها میباشد. دندروگرام UPGMA مبتنی بر ضریب شباهت ژنتیکی نشان داد که در هر دو نشانگر ژنوتیپها بر اساس منطقه جغرافیایی از یکدیگر تفکیک نشدهاند که میتواند به دلیل ماهیت دگرگردهافشانی بالای این گونه و گستره پراکنش کم آن در این نواحی باشد. تجزیه واریانس مولکولی نشان داد که درصد تنوع ژنتیکی درونجمعیتها بیشتر از بینجمعیتها است. تجزیه مدل بیزین STRUCTURE دو گروه (K=2) برای نمونههای مورد مطالعه کاج چلغوزه برآورد کرد که نشاندهنده همآمیزی درون نمونهها میباشد.نتیجهگیری: تفاوت کم بین پنج جمعیت مورد بررسی از نظر تنوع کل و سطوح تمایز جمعیتی با سازوکار رشدی گیاهان چندساله با عمر طولانی و پراکنش منطقهای مطابقت دارد. این نتایج میتواند به حفظ و پرورش این درخت مهم اقتصادی کمک کند.