بررسی ساختار و ‌تنوع‌ ژنتیکی ‌ جمعیت های کاج‌ چلغوزه (Pinus gerardiana‌) افغانستان با‌ استفاده ‌از ‌نشانگرهای ‌‌مولکولی‌ iPBS‌‌ وSCoT

نویسندگان

1 دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهرکرد، شهرکرد

2 عضور هیات علمی/ دانشگاه شهرکرد

3 دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهرکرد، شهرکرد، ایران

doi
10.22092/ijrfpbgr.2023.361428.1433
چکیده

چکیدهسابقه و هدف: کاج چلغوزه در نواحی شرق و جنوب‌شرق افغانستان رشد می­کند و نقش مهمی در توسعه اجتماعی و اقتصادی جوامع روستایی دارد که در مجاورت جنگل­های چلغوزه زندگی می­کنند و از آن به عنوان سوخت، گیاه دارویی، مرتع، پناهگاه دام و آجیلی استفاده می­شود. در این مطالعه تنوع و ساختار ژنتیکی جمعیت­های این درخت با نشانگرهای SCoT و iPBS ارزیابی شد.مواد و روش‌ها: در مجموع 39 ژنوتیپ کاج چلغوزه از مناطق مختلف در پنج استان افغانستان به نام‌های خوست، پکتیا، لغمان، کنر و نورستان جمع‌آوری شد. برای استخراج DNA ژنومی، از روش CTAB اصلاح شده استفاده گردید. تعداد 6 آغازگر از هر نشانگر SCoT و iPBS برای این بررسی استفاده ­شد که به­ترتیب تعداد 48 و 55 نوار SCoT و iPBS تولید کردند. برای تجزیه‌وتحلیل داده‌ها و تعیین روابط ژنتیکی، تجزیه خوشه‌ای انجام شد.یافته ها: در این مطالعه از 12 پرایمر SCoT و iPBS استفاده شد که منجر به تولید 48 باند و 55 باند برای نشانگرهای SCoT و iPBS شد. درصد چندشکلی به ترتیب 8/20 و 1/29 برای نشانگر SCoT و iPBS برآورد شد. میانگین کل PIC به ترتیب 026/0 و 045/0 برای نشانگر SCoT و iPBS تعیین گردید که نشان­دهنده تمایز بیشتر نشانگر iPBS نسبت به SCOT است. ضرایب شباهت ژنتیکی نشان­دهنده تنوع ژنتیکی کم بین­جمعیت­ها می­باشد. دندروگرام UPGMA مبتنی بر ضریب شباهت ژنتیکی نشان داد که در هر دو نشانگر ژنوتیپ­ها بر اساس منطقه جغرافیایی از یکدیگر تفکیک نشده­اند که می­تواند به دلیل ماهیت دگرگرده‌افشانی بالای این گونه و گستره پراکنش کم آن در این نواحی باشد. تجزیه واریانس مولکولی نشان داد که درصد تنوع ژنتیکی درون­جمعیت­ها بیشتر از بین­جمعیت­ها است. تجزیه مدل بیزین STRUCTURE دو گروه (K=2) برای نمونه­های مورد مطالعه کاج چلغوزه برآورد کرد که نشان­دهنده هم­آمیزی درون نمونه­ها می­باشد.نتیجه‌گیری: تفاوت کم بین پنج جمعیت­ مورد بررسی از نظر تنوع کل و سطوح تمایز جمعیتی با سازوکار رشدی گیاهان چندساله با عمر طولانی و پراکنش منطقه­ای مطابقت دارد. این نتایج می‌تواند به حفظ و پرورش این درخت مهم اقتصادی کمک کند.