شناسایی نشانگرهای آگاهی‌بخش SSR و EST-SSR مرتبط با مقاومت به زنگ قهوه‌ای در ژنوتیپ‌های گیاه مرتعی Aegilops tauschii Coss در مرحله گیاهچه‌ای و گیاه کامل

نویسندگان

1 دانشجوی دکتری ژنتیک مولکولی و به‌نژادی گیاهی دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان

2 دانشیار گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی دانشکده تولید گیاهی دانشگاه کشاورزی و علوم منابع طبیعی گرگان

3 استادیار بخش تحقیقات غلات، مؤسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران

4 استادیار گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی دانشکده تولید گیاهی دانشگاه کشاورزی و علوم منابع طبیعی گرگان

5 دانشیار گروه زیست‌فناوری منابع طبیعی، مؤسسه تحقیقات جنگل‌ها و مراتع کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی

6 استادیار گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی دانشکده تولید گیاهی دانشگاه کشاورزی و علوم منابع طبیعی گرگان

doi
10.22092/ijrfpbgr.2022.357703.1410
چکیده

گونهAegilops tauschii ، گیاهی است یکساله و دیپلوئید (2n = 2x = 14, DD) که به‌صورت خودرو در دامنه ارتفاعات و یا دشت‌های نزدیک به سواحل دریاهای غیرآزاد، از ترکیه تا چین رویش دارد. از آنجا که نواحی شمالی ایران به‌عنوان یکی از مهمترین مراکز پیدایش و تنوع این گونه مطرح است، شناسایی منابع مقاومت به زنگ قهوه‌ای (برگ) گندم در این مناطق بسیار اهمیت دارد. در این پژوهش، مقاومت گونه مرتعی آژیلوپس تائوشی (Aegilops tauschii Coss.) نسبت به شش جدایه مختلف عامل بیماری­ زنگ قهوه ­ای در مرحله گیاهچه­ ای و گیاه کامل ارزیابی شد. برای شناسایی نشانگرهای مرتبط با مقاومت گیاهچه به جدایه­ های مختلف و مقاومت گیاه کامل در مزرعه، از نشانگرهای SSR و EST-SSR که پوشش مناسبی روی ژنوم D گندم داشتند، استفاده شد. تجزیه ساختار ژنتیکی جمعیت، نشان داد که یکصد ژنوتیپ مورد ارزیابی در دو زیرجمعیت متمایز قرار گرفتند. پس از محاسبه ماتریس ضرایب ساختار ژنتیکی و همچنین خویشاوندی در جمعیت (Kinship)، تحلیل ارتباط نشانگر- صفت با استفاده از مدل‌های خطی عمومی­ و مختلط انجام شد. قطعات تکثیری آغازگرهای ریزماهواره Xgwm2، Xgwm44 و  Xgwm30 که به‌ترتیب بر روی کروموزوم­های 3D، 7D و 2D و همچنین آغازگرهای SWES186 و SWEW92  از  نشانگرهای EST-SSR که به‌ترتیب بر روی کروموزوم‌های 2D و 7D قرار داشت دارای ارتباط معنی­دار با سطح مقاومت به بیماری زنگ  (با ضریب تبیین بالا) بود. با توجه به ارتباط این نشانگرها با مقاومت اغلب جدایه­ های مطالعه شده، می­توان نتیجه گرفت که به‌عنوان نشانگرهای آگاهی ­بخش، ظرفیت بالایی در گزینش ژنومی و غربالگری سریع ژنوتیپ­ ها به کمک نشانگر دارند.