فهرست نشریات علمی دسترسی آزاد ایران

در این مطالعه از 25 آغازگر SCoT برای مطالعه تنوع ژنتیکی 42 نمونه کاکوتی از مناطق مختلف جغرافیایی ایران استفاده شد. در مجموع 209 قطعه تکثیر شد و 66% از آنها چندشکل بودند. بیشترین قطعات تکثیر شده چند‌شکل (10) مربوط به آغازگر SCoT-54 بود، و همچنین کمترین تعداد قطعات چندشکل (2) مربوط به آغازگر SCoT-20 بود. متوسط تعداد باند برای هر آغازگر 36/8 و متوسط باندهای چندشکل 53/5 بود. محتوای اطلاعات چندشکلی و قدرت تفکیک (PICD) بین 217/0 در آغازگر SCoT-31 و 07/0 در آغازگر SCoT-30 با میانگین 156/0 متغیر بود. ماتریس تشابه با استفاده از ضریب جاکارد، تجزیه خوشه‌ای با الگوریتم UPGMA و تجزیه به مختصات اصلی انجام شد. براساس تجزیه خوشه‌ای، در ضریب تشابه 7/0 نمونه‌های کاکوتی به 7 گروه تقسیم شدند. براساس ماتریس تشابه، کمترین شباهت (59/0) مربوط به ‎دو نمونه نائین و یاسوج، و همچنین بیشترین شباهت (98/0) بین دو نمونه از دامغان و گرمسار از یک منطقه جغرافیایی مشابه بود. نتایج حاصل از تجزیه واریانس مولکولی (AMOVA) حکایت از تنوع زیاد در داخل نمونه‌ها داشت. در واقع 89% از واریانس در داخل نمونه‌ها و 11% از واریانس در بین نمونه‌های کاکوتی بود. در نهایت نتایج نشان‌دهنده تنوع مناسب در بین ژنوتیپ‌های مورد مطالعه بود.