بهینهسازی روش استخراجRNA از بافت پوست شاخه درختان خانواده مخروطیان
نویسندگان
1 استادیار، پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، کرج
2 استادیار، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران، اهواز
3 عضو شرکت دانش بنیان زیست فناوران نوین گیتی ژن، تهران
4 دانشجوی کارشناسی ارشد، اصلاح نباتات، دانشگاه یاسوج، یاسوج
5 نویسنده مسئول مکاتبات، استادیار، دانشکده کشاورزی، دانشگاه یاسوج، یاسوج پست الکترونیک: Masoumiasl@yu.ac.ir
doi
10.22092/ijrfpbgr.2016.106171چکیده
فرآیند استخراج RNA از بافتهای سخت چوبی و بهطور خاص درختان خانواده مخروطیان بهدلیل داشتن غلظتهای بالایی از ترکیبات فنولیک، پلیساکاریدها، متابولیتهای ثانویه و لیگنین، بسیار مشکل است و تا بهحال هیچگونه کیت تجاری برای این منظور ساخته نشده است. در این مطالعه مشکلات فوق برطرف گردیده و روشی سریع، ساده و اقتصادی برای استخراج RNA از بافت ساقه گونههای Cedrus deodara و Abies grandis که هر دو از خانواده مخروطیان میباشند، ارائه شده است. نسبت جذب نوری در طول موجهای 260 به 280 و 260 به 230 نانومتر، بهترتیب 88/1 و 1/1 برای گونه Cedrus deodara و 8/1 و 9/0 برای گونه Abies grandis بهدست آمد. تغییرات صورت گرفته در جهت بهینهسازی استخراج RNA نیز شامل استفاده از تیمار پیشگرما روی بافر استخراج، کاهش دور سانتریفیوژ حذف آلودگی DNA و حذف DEPC میباشد. ساخت cDNA با استفاده از RNA استخراج شده با موفقیت انجام و واکنش RT-PCR باندهای مورد انتظار را تولید نمود. لذا بهنظر میرسد این روش برای استخراج RNA از بافتهای چوبی مناسب است.