شناسایی اکوتیپ‌ها و گونه‌های مختلف مرزه (Satureja spp.) با استفاده از بارکدینگ DNA

نویسندگان

1 دانش آموخته کارشناسی ارشد اصلاح نباتات، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ایلام، ایلام، ایران

2 دانشیار، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ایلام، ایلام، ایران

doi
10.22034/iuvs.2022.540180.1179
چکیده

برخی از گیاهان دو منظوره سبزی-دارویی منابع ارزشمندی هستند که در کشورهای در حال توسعه و پیشرفته مورد توجه قرار گرفته و به عنوان سبزی تازه­خوری یا مواد اولیه جهت تبدیل به دارو­های بی­خطر برای انسان تلقی می­شوند. روش بارکدینگ مولکولی ابزار قابل اعتمادی برای شناسایی گیاهان در سطح جنس و گونه است. در این تکنیک بخش کوچکی از ژنوم گیاه توالی‌یابی شده و برای شناسایی و تعیین ارتباط بین گونه‌های مختلف یک جنس استفاده می‌شود. در پژوهش حاضر  7 اکوتیپ  از گیاه مرزه (S. horentiss, S. bakhtiari, S. biossier, S. mutica, S. bakhtiari) با استفاده از بارکدینگ DNA بررسی شد. DNA ژنومی در سال 1397 در آزمایشگاه بیوتکنولوژی دانشگاه ایلام استخراج گردید و PCR با استفاده از آغازگر‌های اختصاصی برای ژن‌های matK، rbcL و ITS انجام شد. پس از خالص­سازی محصولات PCR مشخص شد که از ژن­های مورد بررسی فقط ژن matK کیفیت مناسبی جهت تفکیک نمونه را نشان داد. همچنین نتایج جستجوی نوکلئوتیدی نشان داد که شباهت بسیار بالایی (بیش از 96 درصد) بین توالی‌های بدست آمده و توالی‌های پایگاه NCBI وجود دارد. تجزیه خوشه‌ای با روش UPGMA ژن matK نشان داد که نمونه­های S. biossier و S. bakhtiarica ایلام و گیلان به همراه نمونه S. hortensis بیرجند و یزد در یک گروه قرار گرفتند و نمونه­های S. bakhtiari  یزد و S. mutica  خراسان در گروه دوم قرار گرفتند. نتایج کلی این تحقیق نشان می دهد که با استفاده ازتوالی­یابی  ژن matK می­توان نمونه­ها را از لحاظ منشاء جغرافیایی از همدیگر تفکیک نماید.