شناسایی اکوتیپها و گونههای مختلف مرزه (Satureja spp.) با استفاده از بارکدینگ DNA
نویسندگان
1 دانش آموخته کارشناسی ارشد اصلاح نباتات، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ایلام، ایلام، ایران
2 دانشیار، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ایلام، ایلام، ایران
doi
10.22034/iuvs.2022.540180.1179چکیده
برخی از گیاهان دو منظوره سبزی-دارویی منابع ارزشمندی هستند که در کشورهای در حال توسعه و پیشرفته مورد توجه قرار گرفته و به عنوان سبزی تازهخوری یا مواد اولیه جهت تبدیل به داروهای بیخطر برای انسان تلقی میشوند. روش بارکدینگ مولکولی ابزار قابل اعتمادی برای شناسایی گیاهان در سطح جنس و گونه است. در این تکنیک بخش کوچکی از ژنوم گیاه توالییابی شده و برای شناسایی و تعیین ارتباط بین گونههای مختلف یک جنس استفاده میشود. در پژوهش حاضر 7 اکوتیپ از گیاه مرزه (S. horentiss, S. bakhtiari, S. biossier, S. mutica, S. bakhtiari) با استفاده از بارکدینگ DNA بررسی شد. DNA ژنومی در سال 1397 در آزمایشگاه بیوتکنولوژی دانشگاه ایلام استخراج گردید و PCR با استفاده از آغازگرهای اختصاصی برای ژنهای matK، rbcL و ITS انجام شد. پس از خالصسازی محصولات PCR مشخص شد که از ژنهای مورد بررسی فقط ژن matK کیفیت مناسبی جهت تفکیک نمونه را نشان داد. همچنین نتایج جستجوی نوکلئوتیدی نشان داد که شباهت بسیار بالایی (بیش از 96 درصد) بین توالیهای بدست آمده و توالیهای پایگاه NCBI وجود دارد. تجزیه خوشهای با روش UPGMA ژن matK نشان داد که نمونههای S. biossier و S. bakhtiarica ایلام و گیلان به همراه نمونه S. hortensis بیرجند و یزد در یک گروه قرار گرفتند و نمونههای S. bakhtiari یزد و S. mutica خراسان در گروه دوم قرار گرفتند. نتایج کلی این تحقیق نشان می دهد که با استفاده ازتوالییابی ژن matK میتوان نمونهها را از لحاظ منشاء جغرافیایی از همدیگر تفکیک نماید.