بررسی تغییرات نوکلئوتیدی ژن LMO1 به عنوان یک تنظیم‌کننده مثبت نسخه‌برداری در بیماران مبتلا به تومورهای مغزی از نوع گلیوبلاستوما

نویسندگان

1 دانش‌آموخته کارشناسی ارشد ژنتیک، گروه زیست شناسی، دانشگاه یزد، یزد، ایران

2 دانشیار ژنتیک مولکولی، گروه زیست شناسی، دانشگاه یزد، یزد، ایران

3 دانشیار ژنتیک مولکولی، گروه زیست شناسی، دانشگاه یزد، یزد، ایران، (نویسنده مسئول)

4 متخصص بیماری های مغز و اعصاب (نورولوژی)، گروه جراحی مغز و اعصاب، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی شهید صدوقی، یزد، ایران

doi
10.22038/mjms.2024.74850.4407
چکیده

مقدمهگلیوبلاستوما یکی از بدخیم‌ترین تومورهای مغزی است که به‌عنوان تومورهای اولیه اپیتلیال عصبی نیز شناخته می‌شود. تومورهای بدخیم گلیوبلاستوما در حدود 40%-20 موارد از تومورهای مغزی را شامل می‌شوند. ژن LMO1 در موقعیت 11P15.4 قرار دارد و به‌عنوان انکوژن در برخی سرطان‌ها معرفی می‌شود. این مطالعه، برای اولین‌بار در ایران، جهت شناسایی و بررسی ارتباط جهش‌های ژن LMO1 با گلیوبلاستوما ، انجام شده است. روش کاردر این تحقیق، از تکنیک Touchdown PCR و روش تعیین‌توالی DNA، در 35 نمونه‌ی خون افراد مبتلا به گلیوبلاستومای مولتی‌فرم و 40 نمونه شاهد استفاده ‌شد. همچنین آنالیزهای بیوانفورماتیکی، برای بررسی اثر پاتوژنسیتی تغییرات نوکلئوتیدی در این ژن انجام شد. نتایجطی این مطالعه، چهار جهش نقطه‌ای شناسایی شد که دو تا از جهش‌های جدید، بدمعنی بوده و منجر به تغییر اسیدآمینه در یکی از دامین‌های مهم پروتئین می‌شدند (p.M135K و p.N148H) که نشان‌دهنده اهمیت بالقوه بیماریزایی آنها است. نتایج مطالعه ما در چندین پایگاه داده بیوانفورماتیکی، پیش‌بینی کرد که هر دو این جهش‌ها بر عملکرد پروتئین اثرگذار هستند، بگونه‌ای که می‌توانند این دامین را مختل کرده و عملکرد آن را دچار نقص کنند. همچنین، یک تغییر نوکلئوتیدی هم در ناحیه 3'UTR این ژن مشاهده شد (c.*74A>G) که در جایگاه اتصال دو miRNA تنظیمی قرار دارد و پیش‌بینی می‌شود بتواند اتصال این miRNAها به توالی هدف را مختل کند. نتیجه‌گیریاین یافته‌ها، پیش‌بینی می‌کنند که هرگونه جهش در دامین‌های حساسLIM در ژنLMO1 به طور قابل‌توجهی با بیماریزایی گلیوبلاستومای مولتی‌فرم مرتبط هستند و به احتمال زیاد بر عملکرد این کوفاکتور نسخه‌برداری تاثیر بسزایی دارند.