انتقال‌پذیری نشانگرهای مولکولی SSRسیب، به ژنوتیپ‌های به (Cydonia oblonga Mill.)

doi
10.22092/spij.2017.111036
چکیده

  بیش از 50 ژنوتیپ و رقم به در کلکسیون ملی کشور جمع‌آوری شده است که اطلاعات مورفولوژیک و ژنتیکی کمی از آن‌ها در اختیار است. به منظور بررسی تنوع ژنتیکی این ژرم‌پلاسم در مرحله اول اقدام به ارزیابی انتقال‌پذیری توالی‌های تکراری ساده مربوط به گونه سیب، به شماری از ژنوتیپ‌های به کشور شد. برای این منظور DNA سیزده ژنوتیپ به استان اصفهان همراه با رقم تجارتی «اصفهان» با روش‌های CTAB تغییر یافته، SDS تغییر یافته و ادغام دو روش CTAB و SDS استخراج و بهترین کیفیت DNA از روش اخیر حاصل شد. DNA این مواد با استفاده از هشت جفت آغازگر SSR سیب شامل CH05d04 ، CH02b10 ، CH02d08 ، CH03g06 ، CH02h11a ، CH04e03 ، CH04a12 و NZ02b01 تکثیر شد. هفت جفت از آغازگرهای مورد استفاده قادر به تکثیر 33 مکان ژنی توالی‌های تکراری ساده ژرم‌پلاسم به مورد ارزیابی بودند، که از این تعداد شش جفت آغازگر تنوع ژنتیکی نشان دادند. جفت آغازگر CH03g06 قادر به تکثیر بیشترین آلل بود و بالاترین شاخص اطلاعاتی پلی‌مورفیسم را نشان داد، در حالی که جفت آغازگر NZ02b01 هیچ قطعه‌ای را تکثیر نکرد . براساس الگوی باندی تولیدی، ژنوتیپ‌های به استان اصفهان در هشت کلاستر به ترتیب دربردارنده 1، 2، 1، 3، 2 ، 2، 1 و 1 ژنوتیپ طبقه‌بندی شدند و به نظر می‌رسد دو ژنوتیپ SHA1 و SVS2 یکسان باشند.