فهرست نشریات علمی دسترسی آزاد ایران

زمینه مطالعاتی: شناسایی متغیرهای مؤثر بر صفات کمی در اصلاح نژاد دام اهمیت بالایی دارد. هدف: در این پژوهش توانایی سه روش مطالعه پویش کل ژنوم بر اساس تک- چند شکلی تک نوکلئوتیدی یا SSGWAS، مکان یابی وراثت پذیری ناحیه‌ای (RHM) و آزمون پویش سریع مبتنی بر سطح‌بندی (fastBAT) برای شناسایی متغیرهای ژنتیکی مؤثر بر صفات کمی، مورد بررسی قرار گرفته است. روش کار: یک جمعیت گاوی با اندازه 4040 رأس دام شبیه سازی شد. برای این جمعیت 3 جفت کروموزم غیر جنسی با تعداد 27586 چند شکلی تک نوکلئوتیدی برای هر کروموزم در نظر گرفته شد. شبیه سازی در قالب 3 سناریو با تعداد 75، 150 و 300 جایگاه صفت کمی و با در نظر گرفتن 10 تکرار برای هر سناریو انجام شد. در بررسی متغیرها ماتریس‌های روابط کل ژنوم و روابط ژنتیکی مبتنی بر شجره در مدل مورد استفاده قرار گرفت. برای مقایسه توانایی روش‌ها در شناسایی QTL ها از معیار تعداد SNP های معنی دار در مجاورت با QTL ها استفاده گردید. نتایج: از مجموع 30 تکرار شبیه سازی شده، در روش SSGWAS تعداد 16 QTL شناسایی شد که 2 QTL دارای فراوانی آلل نادر یا MAF کوچکتر یا مساوی 1/0 بوده و سایر QTL ها با MAF بالاتر از 1/0 شناسایی شدند. در روش fastBAT 107 ناحیه معنی دار شناسایی شد که همه این نواحی حاوی QTL شبیه سازی شده بود. در این روش تعداد 120 QTL در 3 سناریو شناسایی شد که تعداد 52 QTL با MAF کوچکتر یا مساوی 1/0 شناسایی شدند. همه QTL های شناسایی شده در دو روش fastBAT و SSGWAS در روش RHM نیز شناسایی شد. در RHM تعداد 612 ناحیه معنی دار شناسایی شد که همه این نواحی حاوی QTL شبیه سازی شده بودند. در این روش تعداد 316 QTL با MAF کوچکتر یا مساوی 1/0 شناسایی شد. نتیجه‌گیری نهایی: نتایج این بررسی نشان می‌دهد که روش RHM قابلیت بالاتری نسبت به دو روش دیگر در شناسایی QTL های مؤثر بر واریانس صفت کمی دارد.